Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klf9O35739 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klf9O35739 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klf9O35739 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klf9O35739 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klf9O35739 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klf9O35739 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Klf9O35739 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klf9O35739 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klf9O35739 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klf9O35739 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Klf9O35739 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klf9O35739 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klf9O35739 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klf9O35739 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klf9O35739 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klf9O35739 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klf9O35739 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klf9O35739 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Klf9O35739 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klf9O35739 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klf9O35739 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klf9O35739 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klf9O35739 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klf9O35739 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klf9O35739 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klf9O35739 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klf9O35739 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klf9O35739 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klf9O35739 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klf9O35739 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klf9O35739 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klf9O35739 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Klf9O35739 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klf9O35739 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klf9O35739 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klf9O35739 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klf9O35739 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klf9O35739 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klf9O35739 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Klf9O35739 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klf9O35739 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klf9O35739 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klf9O35739 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klf9O35739 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klf9O35739 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klf9O35739 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Klf9O35739 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klf9O35739 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klf9O35739 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klf9O35739 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klf9O35739 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klf9O35739 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klf9O35739 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klf9O35739 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klf9O35739 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klf9O35739 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klf9O35739 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klf9O35739 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klf9O35739 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klf9O35739 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klf9O35739 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klf9O35739 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klf9O35739 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klf9O35739 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klf9O35739 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klf9O35739 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klf9O35739 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klf9O35739 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klf9O35739 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klf9O35739 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klf9O35739 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klf9O35739 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klf9O35739 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klf9O35739 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klf9O35739 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klf9O35739 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klf9O35739 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klf9O35739 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klf9O35739 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Klf9O35739 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klf9O35739 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klf9O35739 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klf9O35739 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klf9O35739 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klf9O35739 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klf9O35739 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klf9O35739 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klf9O35739 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klf9O35739 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Klf9O35739 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klf9O35739 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klf9O35739 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klf9O35739 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klf9O35739 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klf9O35739 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klf9O35739 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klf9O35739 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klf9O35739 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klf9O35739 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms