Protein–RNA interactions for Protein: O35657

Neu1, Sialidase-1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neu1O35657 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Neu1O35657 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Neu1O35657 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Neu1O35657 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Neu1O35657 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Neu1O35657 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Neu1O35657 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Neu1O35657 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Neu1O35657 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Neu1O35657 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Neu1O35657 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Neu1O35657 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Neu1O35657 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Neu1O35657 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Neu1O35657 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Neu1O35657 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Neu1O35657 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Neu1O35657 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Neu1O35657 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Neu1O35657 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Neu1O35657 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Neu1O35657 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Neu1O35657 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Neu1O35657 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Neu1O35657 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Neu1O35657 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Neu1O35657 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Neu1O35657 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Neu1O35657 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Neu1O35657 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Neu1O35657 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Neu1O35657 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Neu1O35657 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Neu1O35657 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Neu1O35657 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Neu1O35657 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Neu1O35657 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neu1O35657 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neu1O35657 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neu1O35657 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neu1O35657 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Neu1O35657 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Neu1O35657 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Neu1O35657 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Neu1O35657 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Neu1O35657 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Neu1O35657 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Neu1O35657 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Neu1O35657 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Neu1O35657 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Neu1O35657 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Neu1O35657 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Neu1O35657 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Neu1O35657 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Neu1O35657 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Neu1O35657 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Neu1O35657 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Neu1O35657 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Neu1O35657 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Neu1O35657 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Neu1O35657 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Neu1O35657 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Neu1O35657 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Neu1O35657 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Neu1O35657 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Neu1O35657 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Neu1O35657 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Neu1O35657 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Neu1O35657 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Neu1O35657 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Neu1O35657 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Neu1O35657 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Neu1O35657 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Neu1O35657 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Neu1O35657 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Neu1O35657 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Neu1O35657 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Neu1O35657 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Neu1O35657 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Neu1O35657 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Neu1O35657 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Neu1O35657 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Neu1O35657 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Neu1O35657 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Neu1O35657 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Neu1O35657 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Neu1O35657 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Neu1O35657 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Neu1O35657 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Neu1O35657 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Neu1O35657 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Neu1O35657 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Neu1O35657 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Neu1O35657 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Neu1O35657 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Neu1O35657 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Neu1O35657 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Neu1O35657 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Neu1O35657 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Neu1O35657 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113 ms