Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Capn6O35646 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Capn6O35646 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Capn6O35646 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Capn6O35646 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Capn6O35646 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Capn6O35646 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Capn6O35646 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Capn6O35646 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Capn6O35646 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Capn6O35646 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Capn6O35646 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Capn6O35646 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Capn6O35646 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Capn6O35646 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Capn6O35646 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Capn6O35646 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Capn6O35646 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Capn6O35646 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Capn6O35646 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Capn6O35646 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Capn6O35646 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Capn6O35646 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Capn6O35646 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Capn6O35646 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Capn6O35646 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Capn6O35646 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Capn6O35646 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Capn6O35646 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Capn6O35646 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Capn6O35646 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Capn6O35646 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Capn6O35646 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Capn6O35646 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Capn6O35646 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Capn6O35646 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Capn6O35646 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Capn6O35646 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Capn6O35646 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Capn6O35646 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Capn6O35646 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Capn6O35646 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Capn6O35646 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Capn6O35646 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Capn6O35646 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Capn6O35646 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Capn6O35646 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Capn6O35646 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Capn6O35646 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Capn6O35646 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Capn6O35646 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Capn6O35646 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Capn6O35646 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Capn6O35646 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Capn6O35646 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Capn6O35646 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Capn6O35646 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Capn6O35646 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Capn6O35646 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Capn6O35646 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Capn6O35646 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Capn6O35646 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Capn6O35646 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Capn6O35646 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Capn6O35646 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Capn6O35646 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Capn6O35646 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Capn6O35646 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Capn6O35646 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Capn6O35646 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Capn6O35646 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Capn6O35646 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Capn6O35646 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Capn6O35646 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Capn6O35646 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Capn6O35646 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Capn6O35646 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Capn6O35646 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Capn6O35646 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Capn6O35646 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Capn6O35646 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Capn6O35646 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Capn6O35646 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Capn6O35646 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Capn6O35646 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Capn6O35646 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Capn6O35646 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Capn6O35646 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Capn6O35646 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Capn6O35646 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Capn6O35646 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Capn6O35646 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Capn6O35646 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Capn6O35646 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Capn6O35646 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Capn6O35646 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Capn6O35646 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Capn6O35646 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capn6O35646 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capn6O35646 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms