Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnih1O35372 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnih1O35372 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnih1O35372 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnih1O35372 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnih1O35372 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnih1O35372 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnih1O35372 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnih1O35372 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnih1O35372 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnih1O35372 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnih1O35372 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnih1O35372 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnih1O35372 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnih1O35372 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnih1O35372 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnih1O35372 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnih1O35372 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnih1O35372 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnih1O35372 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnih1O35372 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnih1O35372 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnih1O35372 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnih1O35372 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnih1O35372 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnih1O35372 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnih1O35372 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnih1O35372 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnih1O35372 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cnih1O35372 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnih1O35372 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnih1O35372 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnih1O35372 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnih1O35372 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnih1O35372 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnih1O35372 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnih1O35372 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnih1O35372 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnih1O35372 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnih1O35372 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnih1O35372 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnih1O35372 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnih1O35372 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnih1O35372 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnih1O35372 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnih1O35372 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnih1O35372 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnih1O35372 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnih1O35372 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnih1O35372 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnih1O35372 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnih1O35372 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnih1O35372 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnih1O35372 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnih1O35372 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnih1O35372 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnih1O35372 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnih1O35372 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnih1O35372 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnih1O35372 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnih1O35372 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnih1O35372 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnih1O35372 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Cnih1O35372 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cnih1O35372 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cnih1O35372 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnih1O35372 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnih1O35372 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnih1O35372 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnih1O35372 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnih1O35372 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnih1O35372 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnih1O35372 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnih1O35372 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnih1O35372 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnih1O35372 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnih1O35372 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnih1O35372 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnih1O35372 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnih1O35372 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnih1O35372 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnih1O35372 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnih1O35372 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnih1O35372 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnih1O35372 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnih1O35372 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnih1O35372 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnih1O35372 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnih1O35372 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnih1O35372 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnih1O35372 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnih1O35372 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnih1O35372 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnih1O35372 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnih1O35372 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnih1O35372 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnih1O35372 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnih1O35372 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnih1O35372 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnih1O35372 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms