Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnfrsf11aO35305 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnfrsf11aO35305 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnfrsf11aO35305 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tnfrsf11aO35305 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnfrsf11aO35305 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tnfrsf11aO35305 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tnfrsf11aO35305 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnfrsf11aO35305 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnfrsf11aO35305 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnfrsf11aO35305 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnfrsf11aO35305 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnfrsf11aO35305 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnfrsf11aO35305 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnfrsf11aO35305 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tnfrsf11aO35305 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tnfrsf11aO35305 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tnfrsf11aO35305 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tnfrsf11aO35305 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnfrsf11aO35305 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnfrsf11aO35305 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnfrsf11aO35305 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnfrsf11aO35305 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tnfrsf11aO35305 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnfrsf11aO35305 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnfrsf11aO35305 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnfrsf11aO35305 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnfrsf11aO35305 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnfrsf11aO35305 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Tnfrsf11aO35305 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Tnfrsf11aO35305 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tnfrsf11aO35305 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tnfrsf11aO35305 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnfrsf11aO35305 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnfrsf11aO35305 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnfrsf11aO35305 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnfrsf11aO35305 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnfrsf11aO35305 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnfrsf11aO35305 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnfrsf11aO35305 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnfrsf11aO35305 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnfrsf11aO35305 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tnfrsf11aO35305 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnfrsf11aO35305 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnfrsf11aO35305 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnfrsf11aO35305 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tnfrsf11aO35305 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnfrsf11aO35305 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnfrsf11aO35305 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnfrsf11aO35305 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnfrsf11aO35305 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnfrsf11aO35305 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnfrsf11aO35305 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnfrsf11aO35305 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnfrsf11aO35305 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnfrsf11aO35305 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnfrsf11aO35305 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnfrsf11aO35305 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnfrsf11aO35305 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnfrsf11aO35305 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnfrsf11aO35305 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnfrsf11aO35305 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnfrsf11aO35305 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Tnfrsf11aO35305 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnfrsf11aO35305 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnfrsf11aO35305 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnfrsf11aO35305 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnfrsf11aO35305 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnfrsf11aO35305 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnfrsf11aO35305 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnfrsf11aO35305 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnfrsf11aO35305 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnfrsf11aO35305 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Tnfrsf11aO35305 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Tnfrsf11aO35305 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tnfrsf11aO35305 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnfrsf11aO35305 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnfrsf11aO35305 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnfrsf11aO35305 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnfrsf11aO35305 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnfrsf11aO35305 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnfrsf11aO35305 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tnfrsf11aO35305 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tnfrsf11aO35305 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Tnfrsf11aO35305 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tnfrsf11aO35305 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Tnfrsf11aO35305 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnfrsf11aO35305 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnfrsf11aO35305 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnfrsf11aO35305 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnfrsf11aO35305 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnfrsf11aO35305 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnfrsf11aO35305 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnfrsf11aO35305 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnfrsf11aO35305 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnfrsf11aO35305 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnfrsf11aO35305 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnfrsf11aO35305 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnfrsf11aO35305 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnfrsf11aO35305 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms