Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nedd9O35177 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nedd9O35177 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nedd9O35177 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nedd9O35177 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nedd9O35177 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nedd9O35177 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nedd9O35177 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nedd9O35177 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nedd9O35177 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nedd9O35177 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nedd9O35177 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nedd9O35177 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Nedd9O35177 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Nedd9O35177 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nedd9O35177 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nedd9O35177 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Nedd9O35177 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nedd9O35177 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nedd9O35177 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nedd9O35177 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nedd9O35177 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nedd9O35177 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nedd9O35177 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nedd9O35177 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nedd9O35177 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nedd9O35177 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nedd9O35177 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nedd9O35177 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nedd9O35177 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nedd9O35177 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nedd9O35177 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nedd9O35177 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nedd9O35177 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nedd9O35177 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nedd9O35177 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nedd9O35177 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nedd9O35177 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nedd9O35177 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nedd9O35177 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nedd9O35177 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nedd9O35177 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nedd9O35177 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nedd9O35177 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nedd9O35177 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nedd9O35177 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nedd9O35177 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nedd9O35177 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nedd9O35177 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nedd9O35177 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nedd9O35177 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nedd9O35177 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nedd9O35177 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nedd9O35177 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nedd9O35177 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nedd9O35177 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nedd9O35177 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nedd9O35177 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nedd9O35177 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nedd9O35177 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nedd9O35177 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nedd9O35177 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nedd9O35177 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Nedd9O35177 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nedd9O35177 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nedd9O35177 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nedd9O35177 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nedd9O35177 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Nedd9O35177 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Nedd9O35177 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nedd9O35177 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nedd9O35177 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nedd9O35177 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nedd9O35177 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nedd9O35177 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nedd9O35177 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nedd9O35177 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nedd9O35177 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nedd9O35177 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nedd9O35177 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Nedd9O35177 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nedd9O35177 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Nedd9O35177 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nedd9O35177 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nedd9O35177 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nedd9O35177 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nedd9O35177 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nedd9O35177 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nedd9O35177 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nedd9O35177 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nedd9O35177 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nedd9O35177 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nedd9O35177 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nedd9O35177 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nedd9O35177 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nedd9O35177 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nedd9O35177 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nedd9O35177 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nedd9O35177 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nedd9O35177 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms