Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc23O35125 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc23O35125 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc23O35125 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc23O35125 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc23O35125 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc23O35125 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc23O35125 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc23O35125 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc23O35125 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc23O35125 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc23O35125 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc23O35125 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc23O35125 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc23O35125 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc23O35125 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc23O35125 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc23O35125 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc23O35125 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc23O35125 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc23O35125 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc23O35125 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc23O35125 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc23O35125 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc23O35125 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc23O35125 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc23O35125 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc23O35125 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc23O35125 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc23O35125 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc23O35125 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc23O35125 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc23O35125 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc23O35125 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc23O35125 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrc23O35125 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrc23O35125 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrc23O35125 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrc23O35125 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc23O35125 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc23O35125 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc23O35125 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc23O35125 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc23O35125 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc23O35125 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc23O35125 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc23O35125 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc23O35125 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc23O35125 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc23O35125 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc23O35125 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc23O35125 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc23O35125 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc23O35125 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc23O35125 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc23O35125 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc23O35125 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc23O35125 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc23O35125 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc23O35125 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc23O35125 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc23O35125 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc23O35125 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc23O35125 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc23O35125 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc23O35125 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc23O35125 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc23O35125 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc23O35125 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc23O35125 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc23O35125 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc23O35125 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc23O35125 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc23O35125 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc23O35125 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc23O35125 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc23O35125 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc23O35125 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc23O35125 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc23O35125 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc23O35125 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc23O35125 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc23O35125 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc23O35125 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc23O35125 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc23O35125 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc23O35125 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc23O35125 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc23O35125 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc23O35125 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc23O35125 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc23O35125 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc23O35125 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc23O35125 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc23O35125 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc23O35125 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc23O35125 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc23O35125 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrc23O35125 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrc23O35125 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms