Protein–RNA interactions for Protein: O09105

Neurod4, Neurogenic differentiation factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod4O09105 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Neurod4O09105 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Neurod4O09105 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Neurod4O09105 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Neurod4O09105 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Neurod4O09105 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Neurod4O09105 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Neurod4O09105 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Neurod4O09105 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Neurod4O09105 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Neurod4O09105 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Neurod4O09105 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Neurod4O09105 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Neurod4O09105 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Neurod4O09105 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Neurod4O09105 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Neurod4O09105 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Neurod4O09105 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Neurod4O09105 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Neurod4O09105 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Neurod4O09105 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Neurod4O09105 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Neurod4O09105 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Neurod4O09105 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Neurod4O09105 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Neurod4O09105 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Neurod4O09105 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Neurod4O09105 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Neurod4O09105 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Neurod4O09105 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Neurod4O09105 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Neurod4O09105 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Neurod4O09105 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Neurod4O09105 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Neurod4O09105 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Neurod4O09105 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Neurod4O09105 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Neurod4O09105 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Neurod4O09105 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Neurod4O09105 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Neurod4O09105 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Neurod4O09105 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Neurod4O09105 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Neurod4O09105 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Neurod4O09105 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Neurod4O09105 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Neurod4O09105 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Neurod4O09105 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Neurod4O09105 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Neurod4O09105 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Neurod4O09105 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Neurod4O09105 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Neurod4O09105 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Neurod4O09105 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Neurod4O09105 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Neurod4O09105 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Neurod4O09105 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Neurod4O09105 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Neurod4O09105 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Neurod4O09105 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Neurod4O09105 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Neurod4O09105 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Neurod4O09105 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Neurod4O09105 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Neurod4O09105 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Neurod4O09105 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Neurod4O09105 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Neurod4O09105 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurod4O09105 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurod4O09105 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurod4O09105 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurod4O09105 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurod4O09105 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurod4O09105 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Neurod4O09105 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Neurod4O09105 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurod4O09105 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurod4O09105 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurod4O09105 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Neurod4O09105 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Neurod4O09105 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurod4O09105 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurod4O09105 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurod4O09105 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod4O09105 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod4O09105 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod4O09105 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurod4O09105 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Neurod4O09105 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurod4O09105 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurod4O09105 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurod4O09105 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurod4O09105 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurod4O09105 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Neurod4O09105 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Neurod4O09105 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurod4O09105 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurod4O09105 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurod4O09105 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Neurod4O09105 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms