Protein–RNA interactions for Protein: O08747

Unc5c, Netrin receptor UNC5C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Unc5cO08747 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Unc5cO08747 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Unc5cO08747 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Unc5cO08747 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Unc5cO08747 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Unc5cO08747 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Unc5cO08747 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Unc5cO08747 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Unc5cO08747 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Unc5cO08747 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Unc5cO08747 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Unc5cO08747 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Unc5cO08747 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Unc5cO08747 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Unc5cO08747 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Unc5cO08747 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Unc5cO08747 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Unc5cO08747 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Unc5cO08747 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Unc5cO08747 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Unc5cO08747 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Unc5cO08747 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Unc5cO08747 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Unc5cO08747 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Unc5cO08747 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Unc5cO08747 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Unc5cO08747 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Unc5cO08747 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Unc5cO08747 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Unc5cO08747 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Unc5cO08747 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Unc5cO08747 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Unc5cO08747 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Unc5cO08747 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Unc5cO08747 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Unc5cO08747 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Unc5cO08747 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Unc5cO08747 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Unc5cO08747 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Unc5cO08747 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Unc5cO08747 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Unc5cO08747 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Unc5cO08747 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Unc5cO08747 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Unc5cO08747 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Unc5cO08747 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Unc5cO08747 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Unc5cO08747 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Unc5cO08747 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Unc5cO08747 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Unc5cO08747 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Unc5cO08747 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Unc5cO08747 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Unc5cO08747 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Unc5cO08747 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Unc5cO08747 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Unc5cO08747 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Unc5cO08747 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Unc5cO08747 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Unc5cO08747 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Unc5cO08747 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Unc5cO08747 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Unc5cO08747 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Unc5cO08747 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Unc5cO08747 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Unc5cO08747 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Unc5cO08747 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Unc5cO08747 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Unc5cO08747 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Unc5cO08747 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Unc5cO08747 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Unc5cO08747 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Unc5cO08747 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Unc5cO08747 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Unc5cO08747 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Unc5cO08747 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Unc5cO08747 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Unc5cO08747 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Unc5cO08747 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Unc5cO08747 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Unc5cO08747 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Unc5cO08747 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Unc5cO08747 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Unc5cO08747 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Unc5cO08747 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Unc5cO08747 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Unc5cO08747 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Unc5cO08747 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Unc5cO08747 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Unc5cO08747 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Unc5cO08747 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Unc5cO08747 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Unc5cO08747 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Unc5cO08747 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Unc5cO08747 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Unc5cO08747 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Unc5cO08747 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Unc5cO08747 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Unc5cO08747 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Unc5cO08747 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms