Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Casp12O08736 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Casp12O08736 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Casp12O08736 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Casp12O08736 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Casp12O08736 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Casp12O08736 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Casp12O08736 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Casp12O08736 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Casp12O08736 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Casp12O08736 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Casp12O08736 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Casp12O08736 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Casp12O08736 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Casp12O08736 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Casp12O08736 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Casp12O08736 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Casp12O08736 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Casp12O08736 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Casp12O08736 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Casp12O08736 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Casp12O08736 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Casp12O08736 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Casp12O08736 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Casp12O08736 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Casp12O08736 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Casp12O08736 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Casp12O08736 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Casp12O08736 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Casp12O08736 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Casp12O08736 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Casp12O08736 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Casp12O08736 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Casp12O08736 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Casp12O08736 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Casp12O08736 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Casp12O08736 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Casp12O08736 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Casp12O08736 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Casp12O08736 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Casp12O08736 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Casp12O08736 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Casp12O08736 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Casp12O08736 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Casp12O08736 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Casp12O08736 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Casp12O08736 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Casp12O08736 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Casp12O08736 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Casp12O08736 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Casp12O08736 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Casp12O08736 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Casp12O08736 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Casp12O08736 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Casp12O08736 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Casp12O08736 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Casp12O08736 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Casp12O08736 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Casp12O08736 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Casp12O08736 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Casp12O08736 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Casp12O08736 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Casp12O08736 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Casp12O08736 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Casp12O08736 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Casp12O08736 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Casp12O08736 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Casp12O08736 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Casp12O08736 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Casp12O08736 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Casp12O08736 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Casp12O08736 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Casp12O08736 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Casp12O08736 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Casp12O08736 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Casp12O08736 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Casp12O08736 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Casp12O08736 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Casp12O08736 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Casp12O08736 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Casp12O08736 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Casp12O08736 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Casp12O08736 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Casp12O08736 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Casp12O08736 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Casp12O08736 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Casp12O08736 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Casp12O08736 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Casp12O08736 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Casp12O08736 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Casp12O08736 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Casp12O08736 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Casp12O08736 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Casp12O08736 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Casp12O08736 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Casp12O08736 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Casp12O08736 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Casp12O08736 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Casp12O08736 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Casp12O08736 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms