Protein–RNA interactions for Protein: O08709

Prdx6, Peroxiredoxin-6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdx6O08709 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdx6O08709 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdx6O08709 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prdx6O08709 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdx6O08709 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prdx6O08709 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prdx6O08709 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdx6O08709 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prdx6O08709 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prdx6O08709 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdx6O08709 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdx6O08709 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdx6O08709 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prdx6O08709 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdx6O08709 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prdx6O08709 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdx6O08709 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prdx6O08709 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdx6O08709 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prdx6O08709 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prdx6O08709 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prdx6O08709 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdx6O08709 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdx6O08709 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdx6O08709 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prdx6O08709 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdx6O08709 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prdx6O08709 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdx6O08709 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdx6O08709 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prdx6O08709 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prdx6O08709 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdx6O08709 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prdx6O08709 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdx6O08709 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prdx6O08709 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdx6O08709 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdx6O08709 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdx6O08709 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdx6O08709 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdx6O08709 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdx6O08709 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdx6O08709 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdx6O08709 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdx6O08709 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdx6O08709 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdx6O08709 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdx6O08709 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdx6O08709 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdx6O08709 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdx6O08709 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdx6O08709 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdx6O08709 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdx6O08709 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdx6O08709 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdx6O08709 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdx6O08709 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdx6O08709 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdx6O08709 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdx6O08709 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdx6O08709 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdx6O08709 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prdx6O08709 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdx6O08709 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdx6O08709 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdx6O08709 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdx6O08709 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdx6O08709 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdx6O08709 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prdx6O08709 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdx6O08709 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdx6O08709 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdx6O08709 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdx6O08709 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdx6O08709 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdx6O08709 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdx6O08709 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdx6O08709 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdx6O08709 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdx6O08709 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdx6O08709 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prdx6O08709 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdx6O08709 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdx6O08709 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdx6O08709 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdx6O08709 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdx6O08709 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdx6O08709 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdx6O08709 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdx6O08709 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdx6O08709 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdx6O08709 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdx6O08709 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdx6O08709 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdx6O08709 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prdx6O08709 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdx6O08709 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdx6O08709 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdx6O08709 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdx6O08709 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms