Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MttpO08601 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MttpO08601 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MttpO08601 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MttpO08601 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MttpO08601 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MttpO08601 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MttpO08601 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MttpO08601 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MttpO08601 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MttpO08601 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MttpO08601 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MttpO08601 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MttpO08601 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MttpO08601 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MttpO08601 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MttpO08601 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MttpO08601 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MttpO08601 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MttpO08601 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MttpO08601 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MttpO08601 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MttpO08601 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MttpO08601 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MttpO08601 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MttpO08601 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MttpO08601 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MttpO08601 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MttpO08601 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MttpO08601 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MttpO08601 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MttpO08601 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MttpO08601 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MttpO08601 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MttpO08601 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MttpO08601 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MttpO08601 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MttpO08601 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MttpO08601 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MttpO08601 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MttpO08601 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MttpO08601 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MttpO08601 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MttpO08601 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MttpO08601 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MttpO08601 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MttpO08601 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MttpO08601 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MttpO08601 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MttpO08601 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MttpO08601 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MttpO08601 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MttpO08601 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MttpO08601 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MttpO08601 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MttpO08601 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MttpO08601 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MttpO08601 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MttpO08601 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MttpO08601 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MttpO08601 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MttpO08601 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MttpO08601 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MttpO08601 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MttpO08601 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MttpO08601 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MttpO08601 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MttpO08601 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MttpO08601 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MttpO08601 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MttpO08601 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MttpO08601 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MttpO08601 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MttpO08601 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MttpO08601 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MttpO08601 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MttpO08601 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MttpO08601 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MttpO08601 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MttpO08601 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MttpO08601 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MttpO08601 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MttpO08601 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MttpO08601 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MttpO08601 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MttpO08601 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MttpO08601 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
MttpO08601 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MttpO08601 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MttpO08601 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MttpO08601 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MttpO08601 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MttpO08601 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MttpO08601 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MttpO08601 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MttpO08601 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MttpO08601 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MttpO08601 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MttpO08601 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MttpO08601 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms