Protein–RNA interactions for Protein: O08576

Rundc3a, RUN domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3aO08576 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rundc3aO08576 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rundc3aO08576 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rundc3aO08576 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rundc3aO08576 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rundc3aO08576 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rundc3aO08576 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rundc3aO08576 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rundc3aO08576 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rundc3aO08576 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rundc3aO08576 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rundc3aO08576 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rundc3aO08576 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rundc3aO08576 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rundc3aO08576 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rundc3aO08576 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rundc3aO08576 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rundc3aO08576 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rundc3aO08576 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rundc3aO08576 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rundc3aO08576 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rundc3aO08576 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rundc3aO08576 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rundc3aO08576 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rundc3aO08576 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rundc3aO08576 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rundc3aO08576 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rundc3aO08576 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rundc3aO08576 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rundc3aO08576 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rundc3aO08576 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rundc3aO08576 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rundc3aO08576 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rundc3aO08576 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rundc3aO08576 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rundc3aO08576 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rundc3aO08576 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rundc3aO08576 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rundc3aO08576 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rundc3aO08576 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rundc3aO08576 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rundc3aO08576 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rundc3aO08576 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rundc3aO08576 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rundc3aO08576 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rundc3aO08576 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rundc3aO08576 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rundc3aO08576 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rundc3aO08576 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rundc3aO08576 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rundc3aO08576 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rundc3aO08576 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rundc3aO08576 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rundc3aO08576 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rundc3aO08576 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rundc3aO08576 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rundc3aO08576 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rundc3aO08576 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rundc3aO08576 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rundc3aO08576 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rundc3aO08576 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rundc3aO08576 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rundc3aO08576 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rundc3aO08576 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rundc3aO08576 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rundc3aO08576 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rundc3aO08576 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rundc3aO08576 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rundc3aO08576 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rundc3aO08576 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rundc3aO08576 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rundc3aO08576 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rundc3aO08576 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rundc3aO08576 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rundc3aO08576 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rundc3aO08576 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rundc3aO08576 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rundc3aO08576 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rundc3aO08576 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rundc3aO08576 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rundc3aO08576 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rundc3aO08576 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rundc3aO08576 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rundc3aO08576 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rundc3aO08576 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rundc3aO08576 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rundc3aO08576 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rundc3aO08576 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rundc3aO08576 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rundc3aO08576 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rundc3aO08576 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rundc3aO08576 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rundc3aO08576 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rundc3aO08576 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rundc3aO08576 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rundc3aO08576 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rundc3aO08576 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rundc3aO08576 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rundc3aO08576 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rundc3aO08576 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms