Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp955bL7N232 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp955bL7N232 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp955bL7N232 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp955bL7N232 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp955bL7N232 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp955bL7N232 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp955bL7N232 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp955bL7N232 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp955bL7N232 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp955bL7N232 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp955bL7N232 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp955bL7N232 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp955bL7N232 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp955bL7N232 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfp955bL7N232 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfp955bL7N232 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfp955bL7N232 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp955bL7N232 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp955bL7N232 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp955bL7N232 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp955bL7N232 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp955bL7N232 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp955bL7N232 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp955bL7N232 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp955bL7N232 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp955bL7N232 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp955bL7N232 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp955bL7N232 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp955bL7N232 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp955bL7N232 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp955bL7N232 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp955bL7N232 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp955bL7N232 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp955bL7N232 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp955bL7N232 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp955bL7N232 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp955bL7N232 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp955bL7N232 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp955bL7N232 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp955bL7N232 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp955bL7N232 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp955bL7N232 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp955bL7N232 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp955bL7N232 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp955bL7N232 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp955bL7N232 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp955bL7N232 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp955bL7N232 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp955bL7N232 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp955bL7N232 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp955bL7N232 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp955bL7N232 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp955bL7N232 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp955bL7N232 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zfp955bL7N232 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zfp955bL7N232 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp955bL7N232 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp955bL7N232 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp955bL7N232 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp955bL7N232 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp955bL7N232 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp955bL7N232 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp955bL7N232 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp955bL7N232 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp955bL7N232 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp955bL7N232 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp955bL7N232 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp955bL7N232 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp955bL7N232 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp955bL7N232 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp955bL7N232 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp955bL7N232 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp955bL7N232 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp955bL7N232 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp955bL7N232 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp955bL7N232 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp955bL7N232 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp955bL7N232 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp955bL7N232 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp955bL7N232 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp955bL7N232 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp955bL7N232 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp955bL7N232 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp955bL7N232 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp955bL7N232 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp955bL7N232 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp955bL7N232 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp955bL7N232 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp955bL7N232 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp955bL7N232 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp955bL7N232 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp955bL7N232 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp955bL7N232 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp955bL7N232 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp955bL7N232 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp955bL7N232 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp955bL7N232 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp955bL7N232 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp955bL7N232 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms