Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2al1oL7MU04 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2al1oL7MU04 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2al1oL7MU04 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2al1oL7MU04 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2al1oL7MU04 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2al1oL7MU04 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2al1oL7MU04 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2al1oL7MU04 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2al1oL7MU04 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
H2al1oL7MU04 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2al1oL7MU04 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2al1oL7MU04 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2al1oL7MU04 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
H2al1oL7MU04 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2al1oL7MU04 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2al1oL7MU04 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2al1oL7MU04 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2al1oL7MU04 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2al1oL7MU04 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2al1oL7MU04 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2al1oL7MU04 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2al1oL7MU04 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2al1oL7MU04 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2al1oL7MU04 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
H2al1oL7MU04 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2al1oL7MU04 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2al1oL7MU04 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2al1oL7MU04 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2al1oL7MU04 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2al1oL7MU04 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2al1oL7MU04 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2al1oL7MU04 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2al1oL7MU04 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2al1oL7MU04 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2al1oL7MU04 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2al1oL7MU04 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2al1oL7MU04 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2al1oL7MU04 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2al1oL7MU04 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2al1oL7MU04 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2al1oL7MU04 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2al1oL7MU04 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2al1oL7MU04 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2al1oL7MU04 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2al1oL7MU04 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2al1oL7MU04 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2al1oL7MU04 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2al1oL7MU04 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2al1oL7MU04 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2al1oL7MU04 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2al1oL7MU04 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2al1oL7MU04 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2al1oL7MU04 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2al1oL7MU04 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2al1oL7MU04 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2al1oL7MU04 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2al1oL7MU04 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2al1oL7MU04 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2al1oL7MU04 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2al1oL7MU04 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2al1oL7MU04 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2al1oL7MU04 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2al1oL7MU04 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2al1oL7MU04 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2al1oL7MU04 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2al1oL7MU04 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2al1oL7MU04 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2al1oL7MU04 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2al1oL7MU04 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2al1oL7MU04 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2al1oL7MU04 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2al1oL7MU04 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2al1oL7MU04 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
H2al1oL7MU04 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2al1oL7MU04 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2al1oL7MU04 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2al1oL7MU04 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2al1oL7MU04 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2al1oL7MU04 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2al1oL7MU04 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2al1oL7MU04 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2al1oL7MU04 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2al1oL7MU04 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2al1oL7MU04 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2al1oL7MU04 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.32■■□□□ 1
H2al1oL7MU04 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2al1oL7MU04 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2al1oL7MU04 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2al1oL7MU04 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2al1oL7MU04 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2al1oL7MU04 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2al1oL7MU04 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2al1oL7MU04 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H2al1oL7MU04 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2al1oL7MU04 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H2al1oL7MU04 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H2al1oL7MU04 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2al1oL7MU04 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2al1oL7MU04 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms