Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm379J3QQ19 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm379J3QQ19 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm379J3QQ19 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm379J3QQ19 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm379J3QQ19 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm379J3QQ19 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm379J3QQ19 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm379J3QQ19 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm379J3QQ19 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm379J3QQ19 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm379J3QQ19 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm379J3QQ19 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm379J3QQ19 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm379J3QQ19 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm379J3QQ19 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm379J3QQ19 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm379J3QQ19 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm379J3QQ19 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm379J3QQ19 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm379J3QQ19 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm379J3QQ19 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm379J3QQ19 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm379J3QQ19 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm379J3QQ19 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm379J3QQ19 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm379J3QQ19 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm379J3QQ19 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm379J3QQ19 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm379J3QQ19 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm379J3QQ19 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm379J3QQ19 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm379J3QQ19 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm379J3QQ19 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm379J3QQ19 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm379J3QQ19 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm379J3QQ19 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm379J3QQ19 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm379J3QQ19 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gm379J3QQ19 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm379J3QQ19 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm379J3QQ19 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm379J3QQ19 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm379J3QQ19 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm379J3QQ19 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm379J3QQ19 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm379J3QQ19 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm379J3QQ19 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm379J3QQ19 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm379J3QQ19 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm379J3QQ19 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm379J3QQ19 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm379J3QQ19 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm379J3QQ19 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm379J3QQ19 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm379J3QQ19 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm379J3QQ19 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm379J3QQ19 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm379J3QQ19 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm379J3QQ19 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm379J3QQ19 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm379J3QQ19 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm379J3QQ19 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm379J3QQ19 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm379J3QQ19 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm379J3QQ19 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm379J3QQ19 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm379J3QQ19 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm379J3QQ19 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm379J3QQ19 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm379J3QQ19 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm379J3QQ19 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm379J3QQ19 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm379J3QQ19 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm379J3QQ19 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm379J3QQ19 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm379J3QQ19 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm379J3QQ19 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm379J3QQ19 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm379J3QQ19 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm379J3QQ19 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm379J3QQ19 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm379J3QQ19 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm379J3QQ19 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm379J3QQ19 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm379J3QQ19 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm379J3QQ19 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm379J3QQ19 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm379J3QQ19 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm379J3QQ19 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm379J3QQ19 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm379J3QQ19 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm379J3QQ19 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm379J3QQ19 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm379J3QQ19 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm379J3QQ19 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm379J3QQ19 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm379J3QQ19 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm379J3QQ19 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm379J3QQ19 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
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