Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20795J3QP49 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20795J3QP49 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20795J3QP49 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20795J3QP49 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20795J3QP49 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20795J3QP49 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20795J3QP49 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20795J3QP49 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20795J3QP49 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm20795J3QP49 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm20795J3QP49 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm20795J3QP49 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20795J3QP49 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20795J3QP49 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20795J3QP49 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20795J3QP49 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20795J3QP49 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20795J3QP49 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20795J3QP49 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20795J3QP49 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20795J3QP49 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20795J3QP49 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20795J3QP49 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gm20795J3QP49 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gm20795J3QP49 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20795J3QP49 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20795J3QP49 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20795J3QP49 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20795J3QP49 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20795J3QP49 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20795J3QP49 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20795J3QP49 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20795J3QP49 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20795J3QP49 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20795J3QP49 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20795J3QP49 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20795J3QP49 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20795J3QP49 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20795J3QP49 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20795J3QP49 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20795J3QP49 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20795J3QP49 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20795J3QP49 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20795J3QP49 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20795J3QP49 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20795J3QP49 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20795J3QP49 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20795J3QP49 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20795J3QP49 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20795J3QP49 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20795J3QP49 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20795J3QP49 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gm20795J3QP49 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20795J3QP49 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20795J3QP49 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20795J3QP49 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20795J3QP49 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20795J3QP49 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20795J3QP49 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20795J3QP49 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20795J3QP49 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20795J3QP49 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20795J3QP49 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20795J3QP49 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20795J3QP49 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20795J3QP49 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20795J3QP49 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20795J3QP49 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20795J3QP49 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20795J3QP49 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20795J3QP49 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm20795J3QP49 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm20795J3QP49 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm20795J3QP49 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20795J3QP49 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20795J3QP49 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20795J3QP49 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20795J3QP49 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20795J3QP49 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20795J3QP49 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20795J3QP49 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20795J3QP49 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20795J3QP49 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20795J3QP49 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20795J3QP49 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20795J3QP49 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20795J3QP49 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20795J3QP49 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20795J3QP49 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20795J3QP49 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20795J3QP49 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20795J3QP49 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20795J3QP49 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20795J3QP49 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20795J3QP49 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20795J3QP49 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20795J3QP49 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20795J3QP49 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20795J3QP49 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms