Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Top6blJ3QMY9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Top6blJ3QMY9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top6blJ3QMY9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top6blJ3QMY9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Top6blJ3QMY9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Top6blJ3QMY9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Top6blJ3QMY9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Top6blJ3QMY9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Top6blJ3QMY9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Top6blJ3QMY9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Top6blJ3QMY9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Top6blJ3QMY9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Top6blJ3QMY9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Top6blJ3QMY9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Top6blJ3QMY9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Top6blJ3QMY9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Top6blJ3QMY9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top6blJ3QMY9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top6blJ3QMY9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top6blJ3QMY9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top6blJ3QMY9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top6blJ3QMY9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top6blJ3QMY9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top6blJ3QMY9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Top6blJ3QMY9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Top6blJ3QMY9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Top6blJ3QMY9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Top6blJ3QMY9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Top6blJ3QMY9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top6blJ3QMY9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top6blJ3QMY9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top6blJ3QMY9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Top6blJ3QMY9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Top6blJ3QMY9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Top6blJ3QMY9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Top6blJ3QMY9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top6blJ3QMY9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Top6blJ3QMY9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top6blJ3QMY9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top6blJ3QMY9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Top6blJ3QMY9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Top6blJ3QMY9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Top6blJ3QMY9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Top6blJ3QMY9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Top6blJ3QMY9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Top6blJ3QMY9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Top6blJ3QMY9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Top6blJ3QMY9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Top6blJ3QMY9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Top6blJ3QMY9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top6blJ3QMY9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top6blJ3QMY9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Top6blJ3QMY9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Top6blJ3QMY9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Top6blJ3QMY9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Top6blJ3QMY9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Top6blJ3QMY9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Top6blJ3QMY9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Top6blJ3QMY9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Top6blJ3QMY9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Top6blJ3QMY9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Top6blJ3QMY9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Top6blJ3QMY9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Top6blJ3QMY9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Top6blJ3QMY9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Top6blJ3QMY9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Top6blJ3QMY9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Top6blJ3QMY9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Top6blJ3QMY9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top6blJ3QMY9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top6blJ3QMY9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top6blJ3QMY9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Top6blJ3QMY9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Top6blJ3QMY9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Top6blJ3QMY9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Top6blJ3QMY9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Top6blJ3QMY9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Top6blJ3QMY9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Top6blJ3QMY9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Top6blJ3QMY9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Top6blJ3QMY9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Top6blJ3QMY9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Top6blJ3QMY9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Top6blJ3QMY9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Top6blJ3QMY9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Top6blJ3QMY9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Top6blJ3QMY9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Top6blJ3QMY9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Top6blJ3QMY9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Top6blJ3QMY9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Top6blJ3QMY9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Top6blJ3QMY9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Top6blJ3QMY9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Top6blJ3QMY9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Top6blJ3QMY9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Top6blJ3QMY9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Top6blJ3QMY9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Top6blJ3QMY9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Top6blJ3QMY9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms