Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Nkx1-1G3UXB3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nkx1-1G3UXB3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nkx1-1G3UXB3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nkx1-1G3UXB3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nkx1-1G3UXB3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nkx1-1G3UXB3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nkx1-1G3UXB3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nkx1-1G3UXB3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nkx1-1G3UXB3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Nkx1-1G3UXB3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Nkx1-1G3UXB3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Nkx1-1G3UXB3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nkx1-1G3UXB3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nkx1-1G3UXB3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nkx1-1G3UXB3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nkx1-1G3UXB3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nkx1-1G3UXB3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nkx1-1G3UXB3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nkx1-1G3UXB3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Nkx1-1G3UXB3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Nkx1-1G3UXB3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nkx1-1G3UXB3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nkx1-1G3UXB3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nkx1-1G3UXB3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nkx1-1G3UXB3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nkx1-1G3UXB3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Nkx1-1G3UXB3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nkx1-1G3UXB3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nkx1-1G3UXB3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nkx1-1G3UXB3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nkx1-1G3UXB3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nkx1-1G3UXB3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nkx1-1G3UXB3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Nkx1-1G3UXB3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nkx1-1G3UXB3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nkx1-1G3UXB3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nkx1-1G3UXB3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nkx1-1G3UXB3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nkx1-1G3UXB3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nkx1-1G3UXB3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nkx1-1G3UXB3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nkx1-1G3UXB3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nkx1-1G3UXB3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nkx1-1G3UXB3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nkx1-1G3UXB3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Nkx1-1G3UXB3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nkx1-1G3UXB3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nkx1-1G3UXB3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Nkx1-1G3UXB3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Nkx1-1G3UXB3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nkx1-1G3UXB3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nkx1-1G3UXB3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nkx1-1G3UXB3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nkx1-1G3UXB3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nkx1-1G3UXB3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nkx1-1G3UXB3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nkx1-1G3UXB3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nkx1-1G3UXB3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Nkx1-1G3UXB3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nkx1-1G3UXB3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nkx1-1G3UXB3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nkx1-1G3UXB3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nkx1-1G3UXB3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nkx1-1G3UXB3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nkx1-1G3UXB3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nkx1-1G3UXB3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nkx1-1G3UXB3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nkx1-1G3UXB3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nkx1-1G3UXB3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nkx1-1G3UXB3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nkx1-1G3UXB3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nkx1-1G3UXB3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nkx1-1G3UXB3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nkx1-1G3UXB3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nkx1-1G3UXB3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nkx1-1G3UXB3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nkx1-1G3UXB3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nkx1-1G3UXB3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nkx1-1G3UXB3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nkx1-1G3UXB3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nkx1-1G3UXB3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nkx1-1G3UXB3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nkx1-1G3UXB3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nkx1-1G3UXB3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nkx1-1G3UXB3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nkx1-1G3UXB3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nkx1-1G3UXB3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nkx1-1G3UXB3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nkx1-1G3UXB3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nkx1-1G3UXB3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nkx1-1G3UXB3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nkx1-1G3UXB3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nkx1-1G3UXB3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nkx1-1G3UXB3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nkx1-1G3UXB3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nkx1-1G3UXB3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nkx1-1G3UXB3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nkx1-1G3UXB3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nkx1-1G3UXB3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms