Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gm5160F8VPN3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm5160F8VPN3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm5160F8VPN3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm5160F8VPN3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm5160F8VPN3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Gm5160F8VPN3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gm5160F8VPN3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm5160F8VPN3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gm5160F8VPN3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gm5160F8VPN3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gm5160F8VPN3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm5160F8VPN3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm5160F8VPN3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm5160F8VPN3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm5160F8VPN3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm5160F8VPN3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Gm5160F8VPN3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm5160F8VPN3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm5160F8VPN3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm5160F8VPN3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm5160F8VPN3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm5160F8VPN3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm5160F8VPN3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm5160F8VPN3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm5160F8VPN3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm5160F8VPN3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Gm5160F8VPN3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gm5160F8VPN3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gm5160F8VPN3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm5160F8VPN3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gm5160F8VPN3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm5160F8VPN3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm5160F8VPN3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm5160F8VPN3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm5160F8VPN3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm5160F8VPN3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm5160F8VPN3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Gm5160F8VPN3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gm5160F8VPN3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm5160F8VPN3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm5160F8VPN3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm5160F8VPN3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm5160F8VPN3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm5160F8VPN3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm5160F8VPN3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm5160F8VPN3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm5160F8VPN3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm5160F8VPN3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm5160F8VPN3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm5160F8VPN3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm5160F8VPN3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm5160F8VPN3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm5160F8VPN3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm5160F8VPN3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm5160F8VPN3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm5160F8VPN3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm5160F8VPN3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm5160F8VPN3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm5160F8VPN3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm5160F8VPN3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm5160F8VPN3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm5160F8VPN3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm5160F8VPN3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm5160F8VPN3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm5160F8VPN3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm5160F8VPN3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm5160F8VPN3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm5160F8VPN3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm5160F8VPN3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm5160F8VPN3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm5160F8VPN3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm5160F8VPN3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm5160F8VPN3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm5160F8VPN3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm5160F8VPN3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm5160F8VPN3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm5160F8VPN3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm5160F8VPN3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm5160F8VPN3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm5160F8VPN3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm5160F8VPN3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm5160F8VPN3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm5160F8VPN3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm5160F8VPN3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm5160F8VPN3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm5160F8VPN3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm5160F8VPN3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm5160F8VPN3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm5160F8VPN3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm5160F8VPN3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm5160F8VPN3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm5160F8VPN3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm5160F8VPN3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm5160F8VPN3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm5160F8VPN3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm5160F8VPN3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm5160F8VPN3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm5160F8VPN3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm5160F8VPN3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms