Protein–RNA interactions for Protein: F6XPD8

Gm9772, Predicted gene 9772, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9772F6XPD8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm9772F6XPD8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm9772F6XPD8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm9772F6XPD8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm9772F6XPD8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm9772F6XPD8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm9772F6XPD8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm9772F6XPD8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm9772F6XPD8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm9772F6XPD8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm9772F6XPD8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm9772F6XPD8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm9772F6XPD8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm9772F6XPD8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm9772F6XPD8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm9772F6XPD8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm9772F6XPD8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm9772F6XPD8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm9772F6XPD8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm9772F6XPD8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm9772F6XPD8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm9772F6XPD8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm9772F6XPD8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm9772F6XPD8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm9772F6XPD8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm9772F6XPD8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm9772F6XPD8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm9772F6XPD8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm9772F6XPD8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm9772F6XPD8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm9772F6XPD8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm9772F6XPD8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm9772F6XPD8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm9772F6XPD8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm9772F6XPD8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm9772F6XPD8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm9772F6XPD8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm9772F6XPD8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm9772F6XPD8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm9772F6XPD8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm9772F6XPD8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm9772F6XPD8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm9772F6XPD8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm9772F6XPD8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm9772F6XPD8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm9772F6XPD8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm9772F6XPD8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm9772F6XPD8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm9772F6XPD8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm9772F6XPD8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm9772F6XPD8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm9772F6XPD8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm9772F6XPD8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm9772F6XPD8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm9772F6XPD8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm9772F6XPD8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm9772F6XPD8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm9772F6XPD8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm9772F6XPD8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm9772F6XPD8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm9772F6XPD8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm9772F6XPD8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm9772F6XPD8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm9772F6XPD8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm9772F6XPD8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm9772F6XPD8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm9772F6XPD8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm9772F6XPD8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm9772F6XPD8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm9772F6XPD8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm9772F6XPD8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm9772F6XPD8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm9772F6XPD8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm9772F6XPD8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm9772F6XPD8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm9772F6XPD8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm9772F6XPD8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm9772F6XPD8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm9772F6XPD8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm9772F6XPD8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm9772F6XPD8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm9772F6XPD8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm9772F6XPD8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm9772F6XPD8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm9772F6XPD8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm9772F6XPD8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm9772F6XPD8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm9772F6XPD8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm9772F6XPD8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm9772F6XPD8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm9772F6XPD8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm9772F6XPD8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm9772F6XPD8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm9772F6XPD8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm9772F6XPD8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm9772F6XPD8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm9772F6XPD8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm9772F6XPD8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm9772F6XPD8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm9772F6XPD8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms