Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm17093F6XGJ4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm17093F6XGJ4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm17093F6XGJ4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm17093F6XGJ4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm17093F6XGJ4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm17093F6XGJ4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm17093F6XGJ4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm17093F6XGJ4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm17093F6XGJ4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm17093F6XGJ4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm17093F6XGJ4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm17093F6XGJ4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm17093F6XGJ4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm17093F6XGJ4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm17093F6XGJ4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm17093F6XGJ4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm17093F6XGJ4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm17093F6XGJ4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm17093F6XGJ4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm17093F6XGJ4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm17093F6XGJ4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm17093F6XGJ4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm17093F6XGJ4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm17093F6XGJ4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm17093F6XGJ4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm17093F6XGJ4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm17093F6XGJ4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm17093F6XGJ4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm17093F6XGJ4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm17093F6XGJ4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm17093F6XGJ4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm17093F6XGJ4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm17093F6XGJ4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm17093F6XGJ4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm17093F6XGJ4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm17093F6XGJ4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm17093F6XGJ4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm17093F6XGJ4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm17093F6XGJ4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm17093F6XGJ4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm17093F6XGJ4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm17093F6XGJ4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm17093F6XGJ4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm17093F6XGJ4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm17093F6XGJ4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm17093F6XGJ4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm17093F6XGJ4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm17093F6XGJ4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm17093F6XGJ4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm17093F6XGJ4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm17093F6XGJ4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm17093F6XGJ4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm17093F6XGJ4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm17093F6XGJ4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm17093F6XGJ4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm17093F6XGJ4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm17093F6XGJ4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm17093F6XGJ4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm17093F6XGJ4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm17093F6XGJ4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm17093F6XGJ4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm17093F6XGJ4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm17093F6XGJ4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm17093F6XGJ4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm17093F6XGJ4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm17093F6XGJ4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Gm17093F6XGJ4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm17093F6XGJ4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm17093F6XGJ4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm17093F6XGJ4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm17093F6XGJ4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm17093F6XGJ4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm17093F6XGJ4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm17093F6XGJ4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm17093F6XGJ4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm17093F6XGJ4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm17093F6XGJ4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm17093F6XGJ4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm17093F6XGJ4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm17093F6XGJ4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm17093F6XGJ4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm17093F6XGJ4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm17093F6XGJ4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm17093F6XGJ4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm17093F6XGJ4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm17093F6XGJ4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm17093F6XGJ4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm17093F6XGJ4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm17093F6XGJ4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm17093F6XGJ4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm17093F6XGJ4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm17093F6XGJ4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm17093F6XGJ4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm17093F6XGJ4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm17093F6XGJ4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm17093F6XGJ4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm17093F6XGJ4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm17093F6XGJ4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm17093F6XGJ4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms