Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Sptbn5F6UCX4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sptbn5F6UCX4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sptbn5F6UCX4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Sptbn5F6UCX4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Sptbn5F6UCX4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Sptbn5F6UCX4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sptbn5F6UCX4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sptbn5F6UCX4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sptbn5F6UCX4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sptbn5F6UCX4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Sptbn5F6UCX4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sptbn5F6UCX4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sptbn5F6UCX4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sptbn5F6UCX4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Sptbn5F6UCX4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sptbn5F6UCX4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sptbn5F6UCX4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sptbn5F6UCX4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sptbn5F6UCX4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sptbn5F6UCX4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sptbn5F6UCX4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sptbn5F6UCX4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sptbn5F6UCX4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sptbn5F6UCX4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sptbn5F6UCX4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sptbn5F6UCX4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sptbn5F6UCX4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Sptbn5F6UCX4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Sptbn5F6UCX4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sptbn5F6UCX4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sptbn5F6UCX4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Sptbn5F6UCX4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Sptbn5F6UCX4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Sptbn5F6UCX4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Sptbn5F6UCX4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Sptbn5F6UCX4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Sptbn5F6UCX4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Sptbn5F6UCX4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Sptbn5F6UCX4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sptbn5F6UCX4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sptbn5F6UCX4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sptbn5F6UCX4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sptbn5F6UCX4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sptbn5F6UCX4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sptbn5F6UCX4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sptbn5F6UCX4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Sptbn5F6UCX4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sptbn5F6UCX4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sptbn5F6UCX4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sptbn5F6UCX4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sptbn5F6UCX4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Sptbn5F6UCX4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sptbn5F6UCX4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sptbn5F6UCX4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sptbn5F6UCX4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Sptbn5F6UCX4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Sptbn5F6UCX4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sptbn5F6UCX4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sptbn5F6UCX4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sptbn5F6UCX4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sptbn5F6UCX4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sptbn5F6UCX4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sptbn5F6UCX4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sptbn5F6UCX4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sptbn5F6UCX4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Sptbn5F6UCX4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sptbn5F6UCX4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sptbn5F6UCX4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sptbn5F6UCX4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sptbn5F6UCX4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sptbn5F6UCX4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sptbn5F6UCX4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sptbn5F6UCX4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sptbn5F6UCX4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sptbn5F6UCX4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sptbn5F6UCX4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sptbn5F6UCX4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sptbn5F6UCX4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sptbn5F6UCX4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Sptbn5F6UCX4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Sptbn5F6UCX4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC30■■■□□ 2.39
Sptbn5F6UCX4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Sptbn5F6UCX4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Sptbn5F6UCX4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sptbn5F6UCX4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sptbn5F6UCX4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Sptbn5F6UCX4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Sptbn5F6UCX4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Sptbn5F6UCX4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Sptbn5F6UCX4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sptbn5F6UCX4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sptbn5F6UCX4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sptbn5F6UCX4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Sptbn5F6UCX4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sptbn5F6UCX4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sptbn5F6UCX4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sptbn5F6UCX4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sptbn5F6UCX4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sptbn5F6UCX4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms