Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf212F6TQD1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf212F6TQD1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf212F6TQD1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf212F6TQD1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf212F6TQD1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf212F6TQD1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf212F6TQD1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf212F6TQD1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf212F6TQD1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf212F6TQD1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf212F6TQD1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf212F6TQD1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf212F6TQD1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnf212F6TQD1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnf212F6TQD1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnf212F6TQD1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnf212F6TQD1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnf212F6TQD1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnf212F6TQD1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf212F6TQD1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf212F6TQD1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf212F6TQD1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf212F6TQD1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf212F6TQD1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf212F6TQD1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf212F6TQD1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf212F6TQD1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf212F6TQD1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf212F6TQD1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf212F6TQD1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf212F6TQD1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf212F6TQD1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf212F6TQD1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf212F6TQD1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf212F6TQD1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf212F6TQD1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf212F6TQD1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf212F6TQD1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf212F6TQD1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf212F6TQD1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf212F6TQD1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf212F6TQD1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf212F6TQD1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf212F6TQD1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf212F6TQD1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf212F6TQD1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf212F6TQD1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf212F6TQD1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf212F6TQD1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf212F6TQD1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf212F6TQD1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf212F6TQD1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf212F6TQD1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf212F6TQD1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf212F6TQD1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf212F6TQD1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf212F6TQD1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf212F6TQD1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf212F6TQD1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf212F6TQD1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf212F6TQD1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf212F6TQD1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf212F6TQD1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf212F6TQD1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf212F6TQD1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf212F6TQD1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf212F6TQD1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf212F6TQD1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf212F6TQD1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf212F6TQD1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf212F6TQD1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf212F6TQD1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf212F6TQD1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf212F6TQD1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf212F6TQD1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf212F6TQD1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf212F6TQD1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf212F6TQD1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf212F6TQD1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf212F6TQD1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf212F6TQD1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf212F6TQD1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf212F6TQD1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf212F6TQD1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf212F6TQD1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf212F6TQD1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf212F6TQD1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf212F6TQD1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf212F6TQD1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf212F6TQD1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf212F6TQD1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf212F6TQD1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf212F6TQD1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf212F6TQD1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf212F6TQD1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf212F6TQD1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf212F6TQD1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf212F6TQD1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf212F6TQD1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms