Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F6

Catsperd, Cation channel sperm-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperdE9Q9F6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CatsperdE9Q9F6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CatsperdE9Q9F6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CatsperdE9Q9F6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CatsperdE9Q9F6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CatsperdE9Q9F6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CatsperdE9Q9F6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CatsperdE9Q9F6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CatsperdE9Q9F6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CatsperdE9Q9F6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CatsperdE9Q9F6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CatsperdE9Q9F6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CatsperdE9Q9F6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CatsperdE9Q9F6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CatsperdE9Q9F6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CatsperdE9Q9F6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CatsperdE9Q9F6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CatsperdE9Q9F6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CatsperdE9Q9F6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CatsperdE9Q9F6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CatsperdE9Q9F6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CatsperdE9Q9F6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CatsperdE9Q9F6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CatsperdE9Q9F6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CatsperdE9Q9F6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatsperdE9Q9F6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatsperdE9Q9F6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatsperdE9Q9F6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatsperdE9Q9F6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CatsperdE9Q9F6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatsperdE9Q9F6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatsperdE9Q9F6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatsperdE9Q9F6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatsperdE9Q9F6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatsperdE9Q9F6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatsperdE9Q9F6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CatsperdE9Q9F6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatsperdE9Q9F6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatsperdE9Q9F6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CatsperdE9Q9F6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatsperdE9Q9F6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatsperdE9Q9F6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatsperdE9Q9F6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CatsperdE9Q9F6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CatsperdE9Q9F6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CatsperdE9Q9F6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatsperdE9Q9F6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CatsperdE9Q9F6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CatsperdE9Q9F6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CatsperdE9Q9F6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CatsperdE9Q9F6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CatsperdE9Q9F6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CatsperdE9Q9F6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CatsperdE9Q9F6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CatsperdE9Q9F6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CatsperdE9Q9F6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CatsperdE9Q9F6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CatsperdE9Q9F6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CatsperdE9Q9F6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CatsperdE9Q9F6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CatsperdE9Q9F6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CatsperdE9Q9F6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CatsperdE9Q9F6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CatsperdE9Q9F6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CatsperdE9Q9F6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CatsperdE9Q9F6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CatsperdE9Q9F6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CatsperdE9Q9F6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CatsperdE9Q9F6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CatsperdE9Q9F6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CatsperdE9Q9F6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CatsperdE9Q9F6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CatsperdE9Q9F6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CatsperdE9Q9F6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CatsperdE9Q9F6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CatsperdE9Q9F6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CatsperdE9Q9F6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CatsperdE9Q9F6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CatsperdE9Q9F6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CatsperdE9Q9F6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CatsperdE9Q9F6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatsperdE9Q9F6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatsperdE9Q9F6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CatsperdE9Q9F6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CatsperdE9Q9F6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CatsperdE9Q9F6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CatsperdE9Q9F6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CatsperdE9Q9F6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CatsperdE9Q9F6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CatsperdE9Q9F6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CatsperdE9Q9F6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CatsperdE9Q9F6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CatsperdE9Q9F6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CatsperdE9Q9F6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CatsperdE9Q9F6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CatsperdE9Q9F6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CatsperdE9Q9F6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CatsperdE9Q9F6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatsperdE9Q9F6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatsperdE9Q9F6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms