Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Rnf169E9Q7F2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Rnf169E9Q7F2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Rnf169E9Q7F2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Rnf169E9Q7F2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25,1■■□□□ 1,61
Rnf169E9Q7F2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Rnf169E9Q7F2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Rnf169E9Q7F2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Rnf169E9Q7F2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Rnf169E9Q7F2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Rnf169E9Q7F2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Rnf169E9Q7F2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Rnf169E9Q7F2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Rnf169E9Q7F2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Rnf169E9Q7F2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Rnf169E9Q7F2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Rnf169E9Q7F2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Rnf169E9Q7F2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Rnf169E9Q7F2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Rnf169E9Q7F2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Rnf169E9Q7F2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Rnf169E9Q7F2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Rnf169E9Q7F2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25,02■■□□□ 1,6
Rnf169E9Q7F2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Rnf169E9Q7F2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Rnf169E9Q7F2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25■■□□□ 1,59
Rnf169E9Q7F2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Rnf169E9Q7F2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Rnf169E9Q7F2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Rnf169E9Q7F2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24,97■■□□□ 1,59
Rnf169E9Q7F2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Rnf169E9Q7F2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Rnf169E9Q7F2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Rnf169E9Q7F2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Rnf169E9Q7F2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Rnf169E9Q7F2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,92■■□□□ 1,58
Rnf169E9Q7F2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Rnf169E9Q7F2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Rnf169E9Q7F2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Rnf169E9Q7F2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Rnf169E9Q7F2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Rnf169E9Q7F2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,89■■□□□ 1,58
Rnf169E9Q7F2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,89■■□□□ 1,58
Rnf169E9Q7F2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Rnf169E9Q7F2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Rnf169E9Q7F2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Rnf169E9Q7F2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Rnf169E9Q7F2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Rnf169E9Q7F2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Rnf169E9Q7F2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Rnf169E9Q7F2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Rnf169E9Q7F2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Rnf169E9Q7F2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Rnf169E9Q7F2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Rnf169E9Q7F2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Rnf169E9Q7F2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Rnf169E9Q7F2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Rnf169E9Q7F2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24,84■■□□□ 1,57
Rnf169E9Q7F2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Rnf169E9Q7F2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Rnf169E9Q7F2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Rnf169E9Q7F2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24,82■■□□□ 1,56
Rnf169E9Q7F2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Rnf169E9Q7F2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Rnf169E9Q7F2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,78■■□□□ 1,56
Rnf169E9Q7F2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Rnf169E9Q7F2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24,76■■□□□ 1,55
Rnf169E9Q7F2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24,76■■□□□ 1,55
Rnf169E9Q7F2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Rnf169E9Q7F2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Rnf169E9Q7F2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Rnf169E9Q7F2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Rnf169E9Q7F2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Rnf169E9Q7F2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24,72■■□□□ 1,55
Rnf169E9Q7F2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Rnf169E9Q7F2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Rnf169E9Q7F2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24,7■■□□□ 1,54
Rnf169E9Q7F2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Rnf169E9Q7F2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Rnf169E9Q7F2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Rnf169E9Q7F2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Rnf169E9Q7F2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Rnf169E9Q7F2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24,65■■□□□ 1,54
Rnf169E9Q7F2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Rnf169E9Q7F2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Rnf169E9Q7F2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24,64■■□□□ 1,54
Rnf169E9Q7F2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Rnf169E9Q7F2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Rnf169E9Q7F2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,64■■□□□ 1,53
Rnf169E9Q7F2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Rnf169E9Q7F2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Rnf169E9Q7F2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Rnf169E9Q7F2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Rnf169E9Q7F2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Rnf169E9Q7F2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Rnf169E9Q7F2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,59■■□□□ 1,53
Rnf169E9Q7F2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Rnf169E9Q7F2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,58■■□□□ 1,52
Rnf169E9Q7F2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Rnf169E9Q7F2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms