Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PtproE9Q612 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PtproE9Q612 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtproE9Q612 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PtproE9Q612 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtproE9Q612 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtproE9Q612 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtproE9Q612 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtproE9Q612 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtproE9Q612 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PtproE9Q612 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PtproE9Q612 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PtproE9Q612 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtproE9Q612 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtproE9Q612 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtproE9Q612 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtproE9Q612 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtproE9Q612 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtproE9Q612 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtproE9Q612 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PtproE9Q612 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtproE9Q612 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtproE9Q612 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtproE9Q612 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PtproE9Q612 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PtproE9Q612 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PtproE9Q612 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtproE9Q612 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtproE9Q612 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtproE9Q612 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtproE9Q612 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtproE9Q612 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtproE9Q612 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtproE9Q612 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtproE9Q612 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PtproE9Q612 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PtproE9Q612 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PtproE9Q612 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtproE9Q612 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtproE9Q612 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtproE9Q612 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PtproE9Q612 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PtproE9Q612 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtproE9Q612 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtproE9Q612 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtproE9Q612 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtproE9Q612 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtproE9Q612 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtproE9Q612 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PtproE9Q612 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PtproE9Q612 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtproE9Q612 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtproE9Q612 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PtproE9Q612 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtproE9Q612 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtproE9Q612 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtproE9Q612 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtproE9Q612 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtproE9Q612 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtproE9Q612 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtproE9Q612 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtproE9Q612 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtproE9Q612 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtproE9Q612 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtproE9Q612 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtproE9Q612 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtproE9Q612 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtproE9Q612 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PtproE9Q612 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtproE9Q612 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PtproE9Q612 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtproE9Q612 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtproE9Q612 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtproE9Q612 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtproE9Q612 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtproE9Q612 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtproE9Q612 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtproE9Q612 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtproE9Q612 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtproE9Q612 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtproE9Q612 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtproE9Q612 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtproE9Q612 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtproE9Q612 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtproE9Q612 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtproE9Q612 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PtproE9Q612 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtproE9Q612 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PtproE9Q612 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PtproE9Q612 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtproE9Q612 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtproE9Q612 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtproE9Q612 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtproE9Q612 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtproE9Q612 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtproE9Q612 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtproE9Q612 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtproE9Q612 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtproE9Q612 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PtproE9Q612 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms