Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pgbd1E9Q492 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pgbd1E9Q492 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pgbd1E9Q492 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pgbd1E9Q492 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pgbd1E9Q492 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pgbd1E9Q492 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pgbd1E9Q492 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pgbd1E9Q492 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pgbd1E9Q492 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pgbd1E9Q492 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pgbd1E9Q492 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pgbd1E9Q492 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pgbd1E9Q492 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pgbd1E9Q492 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pgbd1E9Q492 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pgbd1E9Q492 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pgbd1E9Q492 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pgbd1E9Q492 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pgbd1E9Q492 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pgbd1E9Q492 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pgbd1E9Q492 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pgbd1E9Q492 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pgbd1E9Q492 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pgbd1E9Q492 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pgbd1E9Q492 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pgbd1E9Q492 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pgbd1E9Q492 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pgbd1E9Q492 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pgbd1E9Q492 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pgbd1E9Q492 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pgbd1E9Q492 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pgbd1E9Q492 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pgbd1E9Q492 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pgbd1E9Q492 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pgbd1E9Q492 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pgbd1E9Q492 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pgbd1E9Q492 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pgbd1E9Q492 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pgbd1E9Q492 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pgbd1E9Q492 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pgbd1E9Q492 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pgbd1E9Q492 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pgbd1E9Q492 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pgbd1E9Q492 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pgbd1E9Q492 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pgbd1E9Q492 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pgbd1E9Q492 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pgbd1E9Q492 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pgbd1E9Q492 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pgbd1E9Q492 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pgbd1E9Q492 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pgbd1E9Q492 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pgbd1E9Q492 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pgbd1E9Q492 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pgbd1E9Q492 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pgbd1E9Q492 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pgbd1E9Q492 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pgbd1E9Q492 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pgbd1E9Q492 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pgbd1E9Q492 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pgbd1E9Q492 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pgbd1E9Q492 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pgbd1E9Q492 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pgbd1E9Q492 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgbd1E9Q492 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pgbd1E9Q492 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pgbd1E9Q492 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pgbd1E9Q492 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pgbd1E9Q492 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pgbd1E9Q492 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pgbd1E9Q492 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pgbd1E9Q492 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pgbd1E9Q492 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pgbd1E9Q492 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pgbd1E9Q492 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pgbd1E9Q492 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pgbd1E9Q492 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pgbd1E9Q492 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pgbd1E9Q492 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pgbd1E9Q492 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pgbd1E9Q492 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pgbd1E9Q492 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pgbd1E9Q492 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pgbd1E9Q492 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pgbd1E9Q492 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pgbd1E9Q492 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pgbd1E9Q492 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pgbd1E9Q492 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pgbd1E9Q492 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pgbd1E9Q492 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pgbd1E9Q492 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pgbd1E9Q492 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pgbd1E9Q492 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pgbd1E9Q492 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pgbd1E9Q492 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pgbd1E9Q492 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pgbd1E9Q492 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pgbd1E9Q492 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pgbd1E9Q492 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms