Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Lrp3E9Q1T6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Lrp3E9Q1T6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Lrp3E9Q1T6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23,64■■□□□ 1,37
Lrp3E9Q1T6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23,63■■□□□ 1,37
Lrp3E9Q1T6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Lrp3E9Q1T6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Lrp3E9Q1T6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Lrp3E9Q1T6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Lrp3E9Q1T6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Lrp3E9Q1T6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Lrp3E9Q1T6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Lrp3E9Q1T6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23,52■■□□□ 1,36
Lrp3E9Q1T6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23,52■■□□□ 1,36
Lrp3E9Q1T6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Lrp3E9Q1T6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Lrp3E9Q1T6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Lrp3E9Q1T6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Lrp3E9Q1T6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Lrp3E9Q1T6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Lrp3E9Q1T6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,46■■□□□ 1,35
Lrp3E9Q1T6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Lrp3E9Q1T6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Lrp3E9Q1T6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23,44■■□□□ 1,34
Lrp3E9Q1T6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Lrp3E9Q1T6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Lrp3E9Q1T6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Lrp3E9Q1T6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Lrp3E9Q1T6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Lrp3E9Q1T6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,41■■□□□ 1,34
Lrp3E9Q1T6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Lrp3E9Q1T6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Lrp3E9Q1T6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Lrp3E9Q1T6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23,4■■□□□ 1,34
Lrp3E9Q1T6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,39■■□□□ 1,33
Lrp3E9Q1T6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Lrp3E9Q1T6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,36■■□□□ 1,33
Lrp3E9Q1T6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23,33■■□□□ 1,33
Lrp3E9Q1T6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Lrp3E9Q1T6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23,32■■□□□ 1,32
Lrp3E9Q1T6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Lrp3E9Q1T6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Lrp3E9Q1T6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,3■■□□□ 1,32
Lrp3E9Q1T6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Lrp3E9Q1T6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23,28■■□□□ 1,32
Lrp3E9Q1T6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23,28■■□□□ 1,32
Lrp3E9Q1T6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23,27■■□□□ 1,32
Lrp3E9Q1T6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Lrp3E9Q1T6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Lrp3E9Q1T6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Lrp3E9Q1T6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Lrp3E9Q1T6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,24■■□□□ 1,31
Lrp3E9Q1T6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23,24■■□□□ 1,31
Lrp3E9Q1T6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Lrp3E9Q1T6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Lrp3E9Q1T6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Lrp3E9Q1T6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Lrp3E9Q1T6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Lrp3E9Q1T6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Lrp3E9Q1T6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Lrp3E9Q1T6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23,19■■□□□ 1,3
Lrp3E9Q1T6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Lrp3E9Q1T6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Lrp3E9Q1T6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,18■■□□□ 1,3
Lrp3E9Q1T6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23,17■■□□□ 1,3
Lrp3E9Q1T6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23,17■■□□□ 1,3
Lrp3E9Q1T6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Lrp3E9Q1T6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Lrp3E9Q1T6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Lrp3E9Q1T6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Lrp3E9Q1T6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23,16■■□□□ 1,3
Lrp3E9Q1T6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Lrp3E9Q1T6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Lrp3E9Q1T6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23,14■■□□□ 1,29
Lrp3E9Q1T6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Lrp3E9Q1T6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23,13■■□□□ 1,29
Lrp3E9Q1T6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Lrp3E9Q1T6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,13■■□□□ 1,29
Lrp3E9Q1T6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23,12■■□□□ 1,29
Lrp3E9Q1T6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Lrp3E9Q1T6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23,11■■□□□ 1,29
Lrp3E9Q1T6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Lrp3E9Q1T6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Lrp3E9Q1T6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Lrp3E9Q1T6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Lrp3E9Q1T6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,08■■□□□ 1,28
Lrp3E9Q1T6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Lrp3E9Q1T6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Lrp3E9Q1T6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Lrp3E9Q1T6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23,06■■□□□ 1,28
Lrp3E9Q1T6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Lrp3E9Q1T6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,05■■□□□ 1,28
Lrp3E9Q1T6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Lrp3E9Q1T6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Lrp3E9Q1T6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23,05■■□□□ 1,28
Lrp3E9Q1T6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23,04■■□□□ 1,28
Lrp3E9Q1T6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Lrp3E9Q1T6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Lrp3E9Q1T6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23,03■■□□□ 1,28
Lrp3E9Q1T6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23,03■■□□□ 1,28
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