Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Parp4E9PYK3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Parp4E9PYK3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Parp4E9PYK3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Parp4E9PYK3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Parp4E9PYK3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Parp4E9PYK3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Parp4E9PYK3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Parp4E9PYK3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Parp4E9PYK3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Parp4E9PYK3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Parp4E9PYK3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Parp4E9PYK3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Parp4E9PYK3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Parp4E9PYK3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Parp4E9PYK3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Parp4E9PYK3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Parp4E9PYK3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Parp4E9PYK3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Parp4E9PYK3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Parp4E9PYK3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Parp4E9PYK3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Parp4E9PYK3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Parp4E9PYK3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Parp4E9PYK3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Parp4E9PYK3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Parp4E9PYK3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Parp4E9PYK3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Parp4E9PYK3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Parp4E9PYK3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Parp4E9PYK3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Parp4E9PYK3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Parp4E9PYK3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Parp4E9PYK3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Parp4E9PYK3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Parp4E9PYK3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Parp4E9PYK3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Parp4E9PYK3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Parp4E9PYK3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Parp4E9PYK3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Parp4E9PYK3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Parp4E9PYK3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Parp4E9PYK3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Parp4E9PYK3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Parp4E9PYK3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Parp4E9PYK3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Parp4E9PYK3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Parp4E9PYK3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Parp4E9PYK3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Parp4E9PYK3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Parp4E9PYK3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Parp4E9PYK3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Parp4E9PYK3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Parp4E9PYK3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Parp4E9PYK3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Parp4E9PYK3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Parp4E9PYK3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Parp4E9PYK3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Parp4E9PYK3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Parp4E9PYK3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Parp4E9PYK3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Parp4E9PYK3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Parp4E9PYK3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Parp4E9PYK3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Parp4E9PYK3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Parp4E9PYK3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Parp4E9PYK3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Parp4E9PYK3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Parp4E9PYK3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Parp4E9PYK3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Parp4E9PYK3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Parp4E9PYK3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Parp4E9PYK3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Parp4E9PYK3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Parp4E9PYK3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Parp4E9PYK3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Parp4E9PYK3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Parp4E9PYK3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Parp4E9PYK3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Parp4E9PYK3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Parp4E9PYK3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Parp4E9PYK3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Parp4E9PYK3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Parp4E9PYK3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Parp4E9PYK3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Parp4E9PYK3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Parp4E9PYK3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Parp4E9PYK3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Parp4E9PYK3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Parp4E9PYK3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Parp4E9PYK3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Parp4E9PYK3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Parp4E9PYK3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Parp4E9PYK3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Parp4E9PYK3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Parp4E9PYK3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Parp4E9PYK3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Parp4E9PYK3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Parp4E9PYK3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Parp4E9PYK3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms