Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Sbf2E9PXF8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Sbf2E9PXF8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Sbf2E9PXF8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Sbf2E9PXF8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Sbf2E9PXF8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Sbf2E9PXF8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Sbf2E9PXF8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Sbf2E9PXF8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Sbf2E9PXF8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Sbf2E9PXF8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Sbf2E9PXF8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Sbf2E9PXF8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Sbf2E9PXF8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Sbf2E9PXF8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Sbf2E9PXF8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Sbf2E9PXF8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Sbf2E9PXF8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Sbf2E9PXF8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Sbf2E9PXF8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Sbf2E9PXF8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Sbf2E9PXF8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Sbf2E9PXF8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Sbf2E9PXF8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Sbf2E9PXF8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2,23
Sbf2E9PXF8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Sbf2E9PXF8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Sbf2E9PXF8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Sbf2E9PXF8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28,98■■■□□ 2,23
Sbf2E9PXF8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Sbf2E9PXF8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Sbf2E9PXF8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Sbf2E9PXF8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Sbf2E9PXF8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Sbf2E9PXF8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Sbf2E9PXF8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Sbf2E9PXF8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Sbf2E9PXF8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Sbf2E9PXF8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Sbf2E9PXF8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28,9■■■□□ 2,22
Sbf2E9PXF8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
Sbf2E9PXF8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
Sbf2E9PXF8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Sbf2E9PXF8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Sbf2E9PXF8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Sbf2E9PXF8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,87■■■□□ 2,21
Sbf2E9PXF8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Sbf2E9PXF8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Sbf2E9PXF8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Sbf2E9PXF8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Sbf2E9PXF8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28,85■■■□□ 2,21
Sbf2E9PXF8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Sbf2E9PXF8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Sbf2E9PXF8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Sbf2E9PXF8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Sbf2E9PXF8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Sbf2E9PXF8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28,79■■■□□ 2,2
Sbf2E9PXF8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Sbf2E9PXF8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Sbf2E9PXF8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Sbf2E9PXF8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Sbf2E9PXF8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Sbf2E9PXF8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28,75■■■□□ 2,19
Sbf2E9PXF8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Sbf2E9PXF8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Sbf2E9PXF8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Sbf2E9PXF8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Sbf2E9PXF8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Sbf2E9PXF8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Sbf2E9PXF8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28,7■■■□□ 2,19
Sbf2E9PXF8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Sbf2E9PXF8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Sbf2E9PXF8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Sbf2E9PXF8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Sbf2E9PXF8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Sbf2E9PXF8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,68■■■□□ 2,18
Sbf2E9PXF8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Sbf2E9PXF8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Sbf2E9PXF8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Sbf2E9PXF8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Sbf2E9PXF8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Sbf2E9PXF8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Sbf2E9PXF8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Sbf2E9PXF8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Sbf2E9PXF8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Sbf2E9PXF8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Sbf2E9PXF8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Sbf2E9PXF8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Sbf2E9PXF8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Sbf2E9PXF8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Sbf2E9PXF8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Sbf2E9PXF8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Sbf2E9PXF8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Sbf2E9PXF8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Sbf2E9PXF8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Sbf2E9PXF8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Sbf2E9PXF8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Sbf2E9PXF8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Sbf2E9PXF8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Sbf2E9PXF8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25,7 ms