Protein–RNA interactions for Protein: D6MZJ6

Smpd5, MCG22096, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd5D6MZJ6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smpd5D6MZJ6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smpd5D6MZJ6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smpd5D6MZJ6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Smpd5D6MZJ6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smpd5D6MZJ6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smpd5D6MZJ6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smpd5D6MZJ6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smpd5D6MZJ6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smpd5D6MZJ6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Smpd5D6MZJ6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smpd5D6MZJ6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smpd5D6MZJ6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smpd5D6MZJ6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smpd5D6MZJ6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smpd5D6MZJ6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smpd5D6MZJ6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smpd5D6MZJ6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smpd5D6MZJ6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smpd5D6MZJ6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smpd5D6MZJ6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smpd5D6MZJ6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Smpd5D6MZJ6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Smpd5D6MZJ6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smpd5D6MZJ6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smpd5D6MZJ6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smpd5D6MZJ6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smpd5D6MZJ6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smpd5D6MZJ6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smpd5D6MZJ6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smpd5D6MZJ6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smpd5D6MZJ6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smpd5D6MZJ6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smpd5D6MZJ6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smpd5D6MZJ6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smpd5D6MZJ6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smpd5D6MZJ6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smpd5D6MZJ6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smpd5D6MZJ6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smpd5D6MZJ6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smpd5D6MZJ6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smpd5D6MZJ6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smpd5D6MZJ6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smpd5D6MZJ6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Smpd5D6MZJ6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smpd5D6MZJ6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smpd5D6MZJ6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smpd5D6MZJ6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smpd5D6MZJ6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smpd5D6MZJ6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smpd5D6MZJ6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smpd5D6MZJ6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smpd5D6MZJ6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smpd5D6MZJ6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smpd5D6MZJ6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smpd5D6MZJ6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smpd5D6MZJ6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smpd5D6MZJ6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smpd5D6MZJ6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smpd5D6MZJ6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smpd5D6MZJ6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smpd5D6MZJ6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smpd5D6MZJ6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smpd5D6MZJ6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Smpd5D6MZJ6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smpd5D6MZJ6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smpd5D6MZJ6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smpd5D6MZJ6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Smpd5D6MZJ6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smpd5D6MZJ6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smpd5D6MZJ6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smpd5D6MZJ6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smpd5D6MZJ6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smpd5D6MZJ6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smpd5D6MZJ6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smpd5D6MZJ6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smpd5D6MZJ6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smpd5D6MZJ6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smpd5D6MZJ6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Smpd5D6MZJ6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smpd5D6MZJ6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smpd5D6MZJ6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smpd5D6MZJ6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smpd5D6MZJ6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smpd5D6MZJ6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smpd5D6MZJ6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smpd5D6MZJ6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smpd5D6MZJ6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smpd5D6MZJ6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Smpd5D6MZJ6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smpd5D6MZJ6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smpd5D6MZJ6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smpd5D6MZJ6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smpd5D6MZJ6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smpd5D6MZJ6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smpd5D6MZJ6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smpd5D6MZJ6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smpd5D6MZJ6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smpd5D6MZJ6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smpd5D6MZJ6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms