Protein–RNA interactions for Protein: D4PHA7

Wscd2, WSC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wscd2D4PHA7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Wscd2D4PHA7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Wscd2D4PHA7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Wscd2D4PHA7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Wscd2D4PHA7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Wscd2D4PHA7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Wscd2D4PHA7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Wscd2D4PHA7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Wscd2D4PHA7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Wscd2D4PHA7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Wscd2D4PHA7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Wscd2D4PHA7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Wscd2D4PHA7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Wscd2D4PHA7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Wscd2D4PHA7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wscd2D4PHA7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Wscd2D4PHA7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Wscd2D4PHA7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wscd2D4PHA7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wscd2D4PHA7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wscd2D4PHA7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Wscd2D4PHA7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wscd2D4PHA7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wscd2D4PHA7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wscd2D4PHA7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Wscd2D4PHA7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wscd2D4PHA7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wscd2D4PHA7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Wscd2D4PHA7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Wscd2D4PHA7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Wscd2D4PHA7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Wscd2D4PHA7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Wscd2D4PHA7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Wscd2D4PHA7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Wscd2D4PHA7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Wscd2D4PHA7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Wscd2D4PHA7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Wscd2D4PHA7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Wscd2D4PHA7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Wscd2D4PHA7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Wscd2D4PHA7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Wscd2D4PHA7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Wscd2D4PHA7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Wscd2D4PHA7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Wscd2D4PHA7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Wscd2D4PHA7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Wscd2D4PHA7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Wscd2D4PHA7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Wscd2D4PHA7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Wscd2D4PHA7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Wscd2D4PHA7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Wscd2D4PHA7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Wscd2D4PHA7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Wscd2D4PHA7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Wscd2D4PHA7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Wscd2D4PHA7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Wscd2D4PHA7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Wscd2D4PHA7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Wscd2D4PHA7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Wscd2D4PHA7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Wscd2D4PHA7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Wscd2D4PHA7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Wscd2D4PHA7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Wscd2D4PHA7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Wscd2D4PHA7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Wscd2D4PHA7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wscd2D4PHA7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wscd2D4PHA7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Wscd2D4PHA7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Wscd2D4PHA7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wscd2D4PHA7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wscd2D4PHA7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Wscd2D4PHA7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wscd2D4PHA7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wscd2D4PHA7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Wscd2D4PHA7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wscd2D4PHA7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wscd2D4PHA7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Wscd2D4PHA7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Wscd2D4PHA7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Wscd2D4PHA7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Wscd2D4PHA7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Wscd2D4PHA7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Wscd2D4PHA7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Wscd2D4PHA7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Wscd2D4PHA7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Wscd2D4PHA7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Wscd2D4PHA7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Wscd2D4PHA7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Wscd2D4PHA7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Wscd2D4PHA7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Wscd2D4PHA7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Wscd2D4PHA7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Wscd2D4PHA7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Wscd2D4PHA7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Wscd2D4PHA7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Wscd2D4PHA7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Wscd2D4PHA7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Wscd2D4PHA7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Wscd2D4PHA7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms