Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ldlrad1D3YYZ1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ldlrad1D3YYZ1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ldlrad1D3YYZ1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Ldlrad1D3YYZ1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ldlrad1D3YYZ1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ldlrad1D3YYZ1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ldlrad1D3YYZ1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ldlrad1D3YYZ1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ldlrad1D3YYZ1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ldlrad1D3YYZ1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ldlrad1D3YYZ1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ldlrad1D3YYZ1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ldlrad1D3YYZ1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ldlrad1D3YYZ1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ldlrad1D3YYZ1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ldlrad1D3YYZ1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ldlrad1D3YYZ1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ldlrad1D3YYZ1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ldlrad1D3YYZ1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ldlrad1D3YYZ1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ldlrad1D3YYZ1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ldlrad1D3YYZ1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ldlrad1D3YYZ1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ldlrad1D3YYZ1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ldlrad1D3YYZ1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ldlrad1D3YYZ1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ldlrad1D3YYZ1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ldlrad1D3YYZ1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ldlrad1D3YYZ1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ldlrad1D3YYZ1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Ldlrad1D3YYZ1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ldlrad1D3YYZ1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ldlrad1D3YYZ1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ldlrad1D3YYZ1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ldlrad1D3YYZ1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ldlrad1D3YYZ1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ldlrad1D3YYZ1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ldlrad1D3YYZ1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ldlrad1D3YYZ1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Ldlrad1D3YYZ1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ldlrad1D3YYZ1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Ldlrad1D3YYZ1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ldlrad1D3YYZ1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ldlrad1D3YYZ1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ldlrad1D3YYZ1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ldlrad1D3YYZ1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ldlrad1D3YYZ1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ldlrad1D3YYZ1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Ldlrad1D3YYZ1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ldlrad1D3YYZ1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ldlrad1D3YYZ1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ldlrad1D3YYZ1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ldlrad1D3YYZ1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ldlrad1D3YYZ1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ldlrad1D3YYZ1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ldlrad1D3YYZ1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ldlrad1D3YYZ1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ldlrad1D3YYZ1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ldlrad1D3YYZ1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ldlrad1D3YYZ1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ldlrad1D3YYZ1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ldlrad1D3YYZ1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ldlrad1D3YYZ1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ldlrad1D3YYZ1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ldlrad1D3YYZ1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ldlrad1D3YYZ1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ldlrad1D3YYZ1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ldlrad1D3YYZ1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ldlrad1D3YYZ1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ldlrad1D3YYZ1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ldlrad1D3YYZ1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ldlrad1D3YYZ1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ldlrad1D3YYZ1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ldlrad1D3YYZ1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ldlrad1D3YYZ1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ldlrad1D3YYZ1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ldlrad1D3YYZ1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ldlrad1D3YYZ1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ldlrad1D3YYZ1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ldlrad1D3YYZ1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ldlrad1D3YYZ1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ldlrad1D3YYZ1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ldlrad1D3YYZ1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Ldlrad1D3YYZ1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ldlrad1D3YYZ1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ldlrad1D3YYZ1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ldlrad1D3YYZ1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ldlrad1D3YYZ1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ldlrad1D3YYZ1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ldlrad1D3YYZ1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ldlrad1D3YYZ1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ldlrad1D3YYZ1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ldlrad1D3YYZ1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ldlrad1D3YYZ1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ldlrad1D3YYZ1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ldlrad1D3YYZ1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ldlrad1D3YYZ1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ldlrad1D3YYZ1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ldlrad1D3YYZ1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms