Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf217D3YYI7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf217D3YYI7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf217D3YYI7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf217D3YYI7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf217D3YYI7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf217D3YYI7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf217D3YYI7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf217D3YYI7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf217D3YYI7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf217D3YYI7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf217D3YYI7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf217D3YYI7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf217D3YYI7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf217D3YYI7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf217D3YYI7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf217D3YYI7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf217D3YYI7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rnf217D3YYI7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rnf217D3YYI7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf217D3YYI7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf217D3YYI7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf217D3YYI7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf217D3YYI7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf217D3YYI7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf217D3YYI7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf217D3YYI7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf217D3YYI7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf217D3YYI7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf217D3YYI7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf217D3YYI7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf217D3YYI7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf217D3YYI7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf217D3YYI7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf217D3YYI7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf217D3YYI7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf217D3YYI7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf217D3YYI7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf217D3YYI7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf217D3YYI7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf217D3YYI7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf217D3YYI7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf217D3YYI7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf217D3YYI7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf217D3YYI7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf217D3YYI7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf217D3YYI7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf217D3YYI7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf217D3YYI7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf217D3YYI7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf217D3YYI7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf217D3YYI7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf217D3YYI7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf217D3YYI7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf217D3YYI7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf217D3YYI7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf217D3YYI7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf217D3YYI7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf217D3YYI7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf217D3YYI7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf217D3YYI7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf217D3YYI7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf217D3YYI7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf217D3YYI7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf217D3YYI7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf217D3YYI7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf217D3YYI7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf217D3YYI7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf217D3YYI7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf217D3YYI7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf217D3YYI7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf217D3YYI7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf217D3YYI7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf217D3YYI7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf217D3YYI7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf217D3YYI7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf217D3YYI7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf217D3YYI7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf217D3YYI7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf217D3YYI7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf217D3YYI7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf217D3YYI7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf217D3YYI7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf217D3YYI7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf217D3YYI7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf217D3YYI7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf217D3YYI7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf217D3YYI7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf217D3YYI7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf217D3YYI7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf217D3YYI7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf217D3YYI7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf217D3YYI7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf217D3YYI7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf217D3YYI7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf217D3YYI7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf217D3YYI7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf217D3YYI7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf217D3YYI7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf217D3YYI7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms