Protein–RNA interactions for Protein: D3YV11

Gm5475, Predicted gene 5475, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5475D3YV11 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm5475D3YV11 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm5475D3YV11 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm5475D3YV11 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm5475D3YV11 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm5475D3YV11 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm5475D3YV11 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm5475D3YV11 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm5475D3YV11 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm5475D3YV11 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm5475D3YV11 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm5475D3YV11 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm5475D3YV11 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm5475D3YV11 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm5475D3YV11 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm5475D3YV11 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm5475D3YV11 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm5475D3YV11 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm5475D3YV11 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm5475D3YV11 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm5475D3YV11 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm5475D3YV11 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm5475D3YV11 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5475D3YV11 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm5475D3YV11 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm5475D3YV11 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5475D3YV11 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5475D3YV11 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm5475D3YV11 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm5475D3YV11 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm5475D3YV11 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5475D3YV11 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5475D3YV11 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm5475D3YV11 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm5475D3YV11 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm5475D3YV11 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm5475D3YV11 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm5475D3YV11 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5475D3YV11 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5475D3YV11 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5475D3YV11 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5475D3YV11 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5475D3YV11 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5475D3YV11 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm5475D3YV11 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm5475D3YV11 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm5475D3YV11 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm5475D3YV11 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm5475D3YV11 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm5475D3YV11 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm5475D3YV11 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm5475D3YV11 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm5475D3YV11 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5475D3YV11 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5475D3YV11 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5475D3YV11 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm5475D3YV11 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm5475D3YV11 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm5475D3YV11 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5475D3YV11 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5475D3YV11 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5475D3YV11 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5475D3YV11 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5475D3YV11 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5475D3YV11 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5475D3YV11 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm5475D3YV11 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm5475D3YV11 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm5475D3YV11 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5475D3YV11 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm5475D3YV11 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm5475D3YV11 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm5475D3YV11 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm5475D3YV11 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm5475D3YV11 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm5475D3YV11 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm5475D3YV11 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm5475D3YV11 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm5475D3YV11 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm5475D3YV11 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm5475D3YV11 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm5475D3YV11 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm5475D3YV11 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm5475D3YV11 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm5475D3YV11 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm5475D3YV11 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm5475D3YV11 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm5475D3YV11 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm5475D3YV11 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm5475D3YV11 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm5475D3YV11 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm5475D3YV11 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm5475D3YV11 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm5475D3YV11 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm5475D3YV11 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5475D3YV11 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm5475D3YV11 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm5475D3YV11 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5475D3YV11 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5475D3YV11 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms