Protein–RNA interactions for Protein: B9EJQ9

Rhox3g, Reproductive homeobox 3G, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3gB9EJQ9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox3gB9EJQ9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox3gB9EJQ9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox3gB9EJQ9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox3gB9EJQ9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox3gB9EJQ9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox3gB9EJQ9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox3gB9EJQ9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox3gB9EJQ9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox3gB9EJQ9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox3gB9EJQ9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox3gB9EJQ9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox3gB9EJQ9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox3gB9EJQ9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox3gB9EJQ9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox3gB9EJQ9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rhox3gB9EJQ9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox3gB9EJQ9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox3gB9EJQ9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox3gB9EJQ9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox3gB9EJQ9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox3gB9EJQ9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox3gB9EJQ9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox3gB9EJQ9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox3gB9EJQ9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox3gB9EJQ9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox3gB9EJQ9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox3gB9EJQ9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox3gB9EJQ9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rhox3gB9EJQ9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox3gB9EJQ9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox3gB9EJQ9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox3gB9EJQ9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox3gB9EJQ9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox3gB9EJQ9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox3gB9EJQ9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox3gB9EJQ9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox3gB9EJQ9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox3gB9EJQ9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox3gB9EJQ9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhox3gB9EJQ9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox3gB9EJQ9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox3gB9EJQ9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox3gB9EJQ9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhox3gB9EJQ9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rhox3gB9EJQ9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhox3gB9EJQ9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhox3gB9EJQ9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhox3gB9EJQ9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox3gB9EJQ9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox3gB9EJQ9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox3gB9EJQ9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox3gB9EJQ9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox3gB9EJQ9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox3gB9EJQ9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rhox3gB9EJQ9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox3gB9EJQ9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rhox3gB9EJQ9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rhox3gB9EJQ9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox3gB9EJQ9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox3gB9EJQ9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox3gB9EJQ9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox3gB9EJQ9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox3gB9EJQ9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhox3gB9EJQ9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhox3gB9EJQ9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhox3gB9EJQ9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhox3gB9EJQ9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhox3gB9EJQ9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhox3gB9EJQ9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhox3gB9EJQ9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhox3gB9EJQ9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhox3gB9EJQ9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhox3gB9EJQ9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhox3gB9EJQ9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhox3gB9EJQ9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhox3gB9EJQ9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhox3gB9EJQ9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rhox3gB9EJQ9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rhox3gB9EJQ9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rhox3gB9EJQ9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rhox3gB9EJQ9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rhox3gB9EJQ9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rhox3gB9EJQ9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rhox3gB9EJQ9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rhox3gB9EJQ9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rhox3gB9EJQ9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rhox3gB9EJQ9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rhox3gB9EJQ9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rhox3gB9EJQ9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rhox3gB9EJQ9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rhox3gB9EJQ9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rhox3gB9EJQ9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rhox3gB9EJQ9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rhox3gB9EJQ9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rhox3gB9EJQ9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rhox3gB9EJQ9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rhox3gB9EJQ9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rhox3gB9EJQ9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rhox3gB9EJQ9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms