Protein–RNA interactions for Protein: B2RT41

Zfc3h1, Zinc finger, C3H1-type-containing, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfc3h1B2RT41 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Zfc3h1B2RT41 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Zfc3h1B2RT41 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zfc3h1B2RT41 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zfc3h1B2RT41 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zfc3h1B2RT41 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zfc3h1B2RT41 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Zfc3h1B2RT41 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Zfc3h1B2RT41 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zfc3h1B2RT41 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Zfc3h1B2RT41 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zfc3h1B2RT41 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zfc3h1B2RT41 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zfc3h1B2RT41 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Zfc3h1B2RT41 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zfc3h1B2RT41 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zfc3h1B2RT41 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Zfc3h1B2RT41 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zfc3h1B2RT41 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zfc3h1B2RT41 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zfc3h1B2RT41 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zfc3h1B2RT41 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zfc3h1B2RT41 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zfc3h1B2RT41 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zfc3h1B2RT41 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zfc3h1B2RT41 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Zfc3h1B2RT41 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zfc3h1B2RT41 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zfc3h1B2RT41 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zfc3h1B2RT41 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zfc3h1B2RT41 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zfc3h1B2RT41 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zfc3h1B2RT41 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zfc3h1B2RT41 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zfc3h1B2RT41 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zfc3h1B2RT41 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zfc3h1B2RT41 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zfc3h1B2RT41 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zfc3h1B2RT41 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zfc3h1B2RT41 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zfc3h1B2RT41 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zfc3h1B2RT41 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zfc3h1B2RT41 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Zfc3h1B2RT41 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfc3h1B2RT41 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfc3h1B2RT41 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfc3h1B2RT41 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfc3h1B2RT41 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfc3h1B2RT41 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zfc3h1B2RT41 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zfc3h1B2RT41 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zfc3h1B2RT41 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zfc3h1B2RT41 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zfc3h1B2RT41 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zfc3h1B2RT41 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zfc3h1B2RT41 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zfc3h1B2RT41 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zfc3h1B2RT41 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zfc3h1B2RT41 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zfc3h1B2RT41 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zfc3h1B2RT41 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zfc3h1B2RT41 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zfc3h1B2RT41 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Zfc3h1B2RT41 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zfc3h1B2RT41 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zfc3h1B2RT41 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zfc3h1B2RT41 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zfc3h1B2RT41 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zfc3h1B2RT41 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zfc3h1B2RT41 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfc3h1B2RT41 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zfc3h1B2RT41 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zfc3h1B2RT41 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zfc3h1B2RT41 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zfc3h1B2RT41 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Zfc3h1B2RT41 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zfc3h1B2RT41 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zfc3h1B2RT41 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zfc3h1B2RT41 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfc3h1B2RT41 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfc3h1B2RT41 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfc3h1B2RT41 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfc3h1B2RT41 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfc3h1B2RT41 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfc3h1B2RT41 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfc3h1B2RT41 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zfc3h1B2RT41 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zfc3h1B2RT41 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zfc3h1B2RT41 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zfc3h1B2RT41 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zfc3h1B2RT41 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zfc3h1B2RT41 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zfc3h1B2RT41 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zfc3h1B2RT41 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Zfc3h1B2RT41 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfc3h1B2RT41 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfc3h1B2RT41 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zfc3h1B2RT41 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zfc3h1B2RT41 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zfc3h1B2RT41 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms