Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Grik3B1AS29 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Grik3B1AS29 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Grik3B1AS29 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Grik3B1AS29 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Grik3B1AS29 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Grik3B1AS29 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Grik3B1AS29 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Grik3B1AS29 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Grik3B1AS29 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Grik3B1AS29 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Grik3B1AS29 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Grik3B1AS29 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Grik3B1AS29 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Grik3B1AS29 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Grik3B1AS29 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Grik3B1AS29 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Grik3B1AS29 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Grik3B1AS29 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Grik3B1AS29 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Grik3B1AS29 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Grik3B1AS29 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Grik3B1AS29 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Grik3B1AS29 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Grik3B1AS29 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Grik3B1AS29 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Grik3B1AS29 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Grik3B1AS29 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Grik3B1AS29 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Grik3B1AS29 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Grik3B1AS29 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Grik3B1AS29 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Grik3B1AS29 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Grik3B1AS29 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Grik3B1AS29 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Grik3B1AS29 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Grik3B1AS29 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Grik3B1AS29 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Grik3B1AS29 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Grik3B1AS29 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Grik3B1AS29 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Grik3B1AS29 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Grik3B1AS29 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Grik3B1AS29 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Grik3B1AS29 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Grik3B1AS29 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Grik3B1AS29 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Grik3B1AS29 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Grik3B1AS29 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Grik3B1AS29 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Grik3B1AS29 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Grik3B1AS29 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Grik3B1AS29 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Grik3B1AS29 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Grik3B1AS29 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Grik3B1AS29 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Grik3B1AS29 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Grik3B1AS29 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Grik3B1AS29 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Grik3B1AS29 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Grik3B1AS29 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Grik3B1AS29 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grik3B1AS29 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grik3B1AS29 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Grik3B1AS29 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Grik3B1AS29 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Grik3B1AS29 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Grik3B1AS29 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Grik3B1AS29 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Grik3B1AS29 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Grik3B1AS29 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Grik3B1AS29 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Grik3B1AS29 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Grik3B1AS29 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Grik3B1AS29 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Grik3B1AS29 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Grik3B1AS29 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Grik3B1AS29 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Grik3B1AS29 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Grik3B1AS29 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Grik3B1AS29 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Grik3B1AS29 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Grik3B1AS29 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Grik3B1AS29 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Grik3B1AS29 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Grik3B1AS29 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Grik3B1AS29 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Grik3B1AS29 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Grik3B1AS29 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Grik3B1AS29 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Grik3B1AS29 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Grik3B1AS29 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Grik3B1AS29 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Grik3B1AS29 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Grik3B1AS29 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Grik3B1AS29 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Grik3B1AS29 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Grik3B1AS29 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Grik3B1AS29 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Grik3B1AS29 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms