Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pm20d2A3KG59 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pm20d2A3KG59 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pm20d2A3KG59 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pm20d2A3KG59 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pm20d2A3KG59 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pm20d2A3KG59 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pm20d2A3KG59 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pm20d2A3KG59 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pm20d2A3KG59 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pm20d2A3KG59 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pm20d2A3KG59 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pm20d2A3KG59 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pm20d2A3KG59 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pm20d2A3KG59 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pm20d2A3KG59 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pm20d2A3KG59 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pm20d2A3KG59 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pm20d2A3KG59 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pm20d2A3KG59 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pm20d2A3KG59 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pm20d2A3KG59 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pm20d2A3KG59 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pm20d2A3KG59 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pm20d2A3KG59 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pm20d2A3KG59 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pm20d2A3KG59 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pm20d2A3KG59 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pm20d2A3KG59 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pm20d2A3KG59 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pm20d2A3KG59 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pm20d2A3KG59 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pm20d2A3KG59 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pm20d2A3KG59 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pm20d2A3KG59 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pm20d2A3KG59 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pm20d2A3KG59 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pm20d2A3KG59 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pm20d2A3KG59 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pm20d2A3KG59 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pm20d2A3KG59 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pm20d2A3KG59 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pm20d2A3KG59 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pm20d2A3KG59 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pm20d2A3KG59 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pm20d2A3KG59 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pm20d2A3KG59 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pm20d2A3KG59 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pm20d2A3KG59 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pm20d2A3KG59 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pm20d2A3KG59 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pm20d2A3KG59 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pm20d2A3KG59 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pm20d2A3KG59 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pm20d2A3KG59 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pm20d2A3KG59 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pm20d2A3KG59 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pm20d2A3KG59 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pm20d2A3KG59 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pm20d2A3KG59 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Pm20d2A3KG59 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pm20d2A3KG59 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Pm20d2A3KG59 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pm20d2A3KG59 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pm20d2A3KG59 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pm20d2A3KG59 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pm20d2A3KG59 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pm20d2A3KG59 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pm20d2A3KG59 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pm20d2A3KG59 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pm20d2A3KG59 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pm20d2A3KG59 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pm20d2A3KG59 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pm20d2A3KG59 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pm20d2A3KG59 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pm20d2A3KG59 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pm20d2A3KG59 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pm20d2A3KG59 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pm20d2A3KG59 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pm20d2A3KG59 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pm20d2A3KG59 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pm20d2A3KG59 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pm20d2A3KG59 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pm20d2A3KG59 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pm20d2A3KG59 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pm20d2A3KG59 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pm20d2A3KG59 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pm20d2A3KG59 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pm20d2A3KG59 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pm20d2A3KG59 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pm20d2A3KG59 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pm20d2A3KG59 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pm20d2A3KG59 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pm20d2A3KG59 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pm20d2A3KG59 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pm20d2A3KG59 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pm20d2A3KG59 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pm20d2A3KG59 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pm20d2A3KG59 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pm20d2A3KG59 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms