Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm6880A3KG45 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm6880A3KG45 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm6880A3KG45 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm6880A3KG45 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm6880A3KG45 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm6880A3KG45 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm6880A3KG45 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm6880A3KG45 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm6880A3KG45 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm6880A3KG45 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm6880A3KG45 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm6880A3KG45 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm6880A3KG45 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm6880A3KG45 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm6880A3KG45 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm6880A3KG45 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm6880A3KG45 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm6880A3KG45 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm6880A3KG45 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm6880A3KG45 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm6880A3KG45 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm6880A3KG45 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm6880A3KG45 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm6880A3KG45 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm6880A3KG45 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm6880A3KG45 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm6880A3KG45 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm6880A3KG45 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm6880A3KG45 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm6880A3KG45 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm6880A3KG45 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm6880A3KG45 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm6880A3KG45 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm6880A3KG45 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm6880A3KG45 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm6880A3KG45 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm6880A3KG45 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm6880A3KG45 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm6880A3KG45 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm6880A3KG45 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm6880A3KG45 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm6880A3KG45 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm6880A3KG45 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm6880A3KG45 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm6880A3KG45 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm6880A3KG45 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm6880A3KG45 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm6880A3KG45 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm6880A3KG45 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm6880A3KG45 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm6880A3KG45 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm6880A3KG45 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm6880A3KG45 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm6880A3KG45 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm6880A3KG45 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm6880A3KG45 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm6880A3KG45 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm6880A3KG45 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm6880A3KG45 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm6880A3KG45 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm6880A3KG45 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm6880A3KG45 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm6880A3KG45 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm6880A3KG45 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm6880A3KG45 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm6880A3KG45 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm6880A3KG45 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm6880A3KG45 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm6880A3KG45 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm6880A3KG45 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm6880A3KG45 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm6880A3KG45 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm6880A3KG45 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm6880A3KG45 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm6880A3KG45 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm6880A3KG45 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm6880A3KG45 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm6880A3KG45 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm6880A3KG45 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm6880A3KG45 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm6880A3KG45 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm6880A3KG45 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm6880A3KG45 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm6880A3KG45 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm6880A3KG45 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm6880A3KG45 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm6880A3KG45 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm6880A3KG45 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm6880A3KG45 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm6880A3KG45 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm6880A3KG45 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm6880A3KG45 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6880A3KG45 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6880A3KG45 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm6880A3KG45 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm6880A3KG45 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm6880A3KG45 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm6880A3KG45 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm6880A3KG45 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms