Protein–RNA interactions for Protein: A2ANE0

Rhox2f, MCG113260, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2fA2ANE0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhox2fA2ANE0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhox2fA2ANE0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhox2fA2ANE0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhox2fA2ANE0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhox2fA2ANE0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhox2fA2ANE0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhox2fA2ANE0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhox2fA2ANE0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhox2fA2ANE0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhox2fA2ANE0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhox2fA2ANE0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhox2fA2ANE0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhox2fA2ANE0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhox2fA2ANE0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhox2fA2ANE0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhox2fA2ANE0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhox2fA2ANE0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhox2fA2ANE0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhox2fA2ANE0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhox2fA2ANE0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rhox2fA2ANE0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhox2fA2ANE0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhox2fA2ANE0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rhox2fA2ANE0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rhox2fA2ANE0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhox2fA2ANE0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhox2fA2ANE0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhox2fA2ANE0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhox2fA2ANE0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhox2fA2ANE0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhox2fA2ANE0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhox2fA2ANE0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhox2fA2ANE0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhox2fA2ANE0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhox2fA2ANE0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhox2fA2ANE0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhox2fA2ANE0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhox2fA2ANE0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhox2fA2ANE0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhox2fA2ANE0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhox2fA2ANE0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhox2fA2ANE0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhox2fA2ANE0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhox2fA2ANE0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhox2fA2ANE0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhox2fA2ANE0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhox2fA2ANE0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhox2fA2ANE0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rhox2fA2ANE0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rhox2fA2ANE0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhox2fA2ANE0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhox2fA2ANE0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhox2fA2ANE0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhox2fA2ANE0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhox2fA2ANE0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhox2fA2ANE0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhox2fA2ANE0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhox2fA2ANE0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhox2fA2ANE0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhox2fA2ANE0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhox2fA2ANE0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhox2fA2ANE0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhox2fA2ANE0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhox2fA2ANE0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhox2fA2ANE0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhox2fA2ANE0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox2fA2ANE0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox2fA2ANE0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox2fA2ANE0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhox2fA2ANE0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox2fA2ANE0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox2fA2ANE0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox2fA2ANE0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox2fA2ANE0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhox2fA2ANE0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhox2fA2ANE0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhox2fA2ANE0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhox2fA2ANE0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox2fA2ANE0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox2fA2ANE0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhox2fA2ANE0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox2fA2ANE0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox2fA2ANE0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox2fA2ANE0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox2fA2ANE0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhox2fA2ANE0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhox2fA2ANE0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhox2fA2ANE0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhox2fA2ANE0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhox2fA2ANE0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhox2fA2ANE0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhox2fA2ANE0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhox2fA2ANE0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhox2fA2ANE0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhox2fA2ANE0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhox2fA2ANE0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhox2fA2ANE0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhox2fA2ANE0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhox2fA2ANE0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms