Protein–RNA interactions for Protein: A2AMD2

Ankrd60, Ankyrin repeat domain 60, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd60A2AMD2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd60A2AMD2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd60A2AMD2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd60A2AMD2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ankrd60A2AMD2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ankrd60A2AMD2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd60A2AMD2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd60A2AMD2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd60A2AMD2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd60A2AMD2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd60A2AMD2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd60A2AMD2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ankrd60A2AMD2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ankrd60A2AMD2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ankrd60A2AMD2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd60A2AMD2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd60A2AMD2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd60A2AMD2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd60A2AMD2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd60A2AMD2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd60A2AMD2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd60A2AMD2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd60A2AMD2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd60A2AMD2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd60A2AMD2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd60A2AMD2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd60A2AMD2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd60A2AMD2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd60A2AMD2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd60A2AMD2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd60A2AMD2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd60A2AMD2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd60A2AMD2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd60A2AMD2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd60A2AMD2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd60A2AMD2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd60A2AMD2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd60A2AMD2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd60A2AMD2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd60A2AMD2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd60A2AMD2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd60A2AMD2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd60A2AMD2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd60A2AMD2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd60A2AMD2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd60A2AMD2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd60A2AMD2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd60A2AMD2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd60A2AMD2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd60A2AMD2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd60A2AMD2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd60A2AMD2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd60A2AMD2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd60A2AMD2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd60A2AMD2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd60A2AMD2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd60A2AMD2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd60A2AMD2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd60A2AMD2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd60A2AMD2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd60A2AMD2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd60A2AMD2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd60A2AMD2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd60A2AMD2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd60A2AMD2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ankrd60A2AMD2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ankrd60A2AMD2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ankrd60A2AMD2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd60A2AMD2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd60A2AMD2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd60A2AMD2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd60A2AMD2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd60A2AMD2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd60A2AMD2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd60A2AMD2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ankrd60A2AMD2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd60A2AMD2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd60A2AMD2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd60A2AMD2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd60A2AMD2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd60A2AMD2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd60A2AMD2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd60A2AMD2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd60A2AMD2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd60A2AMD2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd60A2AMD2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd60A2AMD2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ankrd60A2AMD2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd60A2AMD2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd60A2AMD2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd60A2AMD2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd60A2AMD2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd60A2AMD2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd60A2AMD2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd60A2AMD2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd60A2AMD2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd60A2AMD2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd60A2AMD2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd60A2AMD2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd60A2AMD2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms