Protein–RNA interactions for Protein: A2AEP0

Obp1b, Odorant-binding protein 1b, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obp1bA2AEP0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Obp1bA2AEP0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21,36■■□□□ 1,01
Obp1bA2AEP0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Obp1bA2AEP0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Obp1bA2AEP0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Obp1bA2AEP0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Obp1bA2AEP0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21,34■■□□□ 1,01
Obp1bA2AEP0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21,34■■□□□ 1,01
Obp1bA2AEP0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Obp1bA2AEP0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Obp1bA2AEP0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1
Obp1bA2AEP0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,32■■□□□ 1
Obp1bA2AEP0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Obp1bA2AEP0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Obp1bA2AEP0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,3■■□□□ 1
Obp1bA2AEP0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Obp1bA2AEP0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,3■■□□□ 1
Obp1bA2AEP0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Obp1bA2AEP0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Obp1bA2AEP0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Obp1bA2AEP0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Obp1bA2AEP0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Obp1bA2AEP0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Obp1bA2AEP0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Obp1bA2AEP0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,26■□□□□ 0,99
Obp1bA2AEP0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Obp1bA2AEP0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Obp1bA2AEP0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Obp1bA2AEP0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Obp1bA2AEP0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Obp1bA2AEP0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Obp1bA2AEP0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Obp1bA2AEP0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Obp1bA2AEP0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21,22■□□□□ 0,99
Obp1bA2AEP0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,22■□□□□ 0,99
Obp1bA2AEP0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Obp1bA2AEP0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Obp1bA2AEP0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21,21■□□□□ 0,99
Obp1bA2AEP0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Obp1bA2AEP0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Obp1bA2AEP0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Obp1bA2AEP0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Obp1bA2AEP0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Obp1bA2AEP0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21,18■□□□□ 0,98
Obp1bA2AEP0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Obp1bA2AEP0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21,18■□□□□ 0,98
Obp1bA2AEP0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Obp1bA2AEP0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Obp1bA2AEP0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,17■□□□□ 0,98
Obp1bA2AEP0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Obp1bA2AEP0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21,15■□□□□ 0,98
Obp1bA2AEP0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Obp1bA2AEP0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Obp1bA2AEP0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,98
Obp1bA2AEP0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Obp1bA2AEP0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Obp1bA2AEP0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Obp1bA2AEP0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Obp1bA2AEP0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21,12■□□□□ 0,97
Obp1bA2AEP0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Obp1bA2AEP0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,11■□□□□ 0,97
Obp1bA2AEP0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Obp1bA2AEP0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Obp1bA2AEP0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,09■□□□□ 0,97
Obp1bA2AEP0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,09■□□□□ 0,97
Obp1bA2AEP0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Obp1bA2AEP0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Obp1bA2AEP0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21,08■□□□□ 0,97
Obp1bA2AEP0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Obp1bA2AEP0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,96
Obp1bA2AEP0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21,07■□□□□ 0,96
Obp1bA2AEP0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Obp1bA2AEP0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21,07■□□□□ 0,96
Obp1bA2AEP0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Obp1bA2AEP0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21,06■□□□□ 0,96
Obp1bA2AEP0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Obp1bA2AEP0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Obp1bA2AEP0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Obp1bA2AEP0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Obp1bA2AEP0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21,03■□□□□ 0,96
Obp1bA2AEP0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Obp1bA2AEP0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Obp1bA2AEP0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21,02■□□□□ 0,95
Obp1bA2AEP0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Obp1bA2AEP0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Obp1bA2AEP0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Obp1bA2AEP0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21,01■□□□□ 0,95
Obp1bA2AEP0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Obp1bA2AEP0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0,95
Obp1bA2AEP0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Obp1bA2AEP0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Obp1bA2AEP0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Obp1bA2AEP0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Obp1bA2AEP0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Obp1bA2AEP0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Obp1bA2AEP0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Obp1bA2AEP0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Obp1bA2AEP0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Obp1bA2AEP0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Obp1bA2AEP0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22,9 ms