Protein–RNA interactions for Protein: A2A8U2

Tmem201, Transmembrane protein 201, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem201A2A8U2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem201A2A8U2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem201A2A8U2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem201A2A8U2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem201A2A8U2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem201A2A8U2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem201A2A8U2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem201A2A8U2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem201A2A8U2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem201A2A8U2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem201A2A8U2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem201A2A8U2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem201A2A8U2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem201A2A8U2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem201A2A8U2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem201A2A8U2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem201A2A8U2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem201A2A8U2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem201A2A8U2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem201A2A8U2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem201A2A8U2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem201A2A8U2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem201A2A8U2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem201A2A8U2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem201A2A8U2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem201A2A8U2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem201A2A8U2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem201A2A8U2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem201A2A8U2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem201A2A8U2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem201A2A8U2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem201A2A8U2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem201A2A8U2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem201A2A8U2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem201A2A8U2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem201A2A8U2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem201A2A8U2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem201A2A8U2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem201A2A8U2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem201A2A8U2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem201A2A8U2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem201A2A8U2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem201A2A8U2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem201A2A8U2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem201A2A8U2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem201A2A8U2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem201A2A8U2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem201A2A8U2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem201A2A8U2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem201A2A8U2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem201A2A8U2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem201A2A8U2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem201A2A8U2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem201A2A8U2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem201A2A8U2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmem201A2A8U2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem201A2A8U2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem201A2A8U2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem201A2A8U2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem201A2A8U2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem201A2A8U2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem201A2A8U2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem201A2A8U2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem201A2A8U2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem201A2A8U2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem201A2A8U2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem201A2A8U2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem201A2A8U2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem201A2A8U2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem201A2A8U2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem201A2A8U2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem201A2A8U2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem201A2A8U2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem201A2A8U2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem201A2A8U2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem201A2A8U2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem201A2A8U2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem201A2A8U2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem201A2A8U2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem201A2A8U2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem201A2A8U2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem201A2A8U2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem201A2A8U2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem201A2A8U2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem201A2A8U2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem201A2A8U2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem201A2A8U2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem201A2A8U2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem201A2A8U2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem201A2A8U2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem201A2A8U2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem201A2A8U2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem201A2A8U2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem201A2A8U2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem201A2A8U2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem201A2A8U2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem201A2A8U2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem201A2A8U2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem201A2A8U2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem201A2A8U2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms