Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Prdm2A2A7B5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Prdm2A2A7B5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Prdm2A2A7B5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Prdm2A2A7B5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Prdm2A2A7B5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Prdm2A2A7B5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Prdm2A2A7B5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Prdm2A2A7B5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Prdm2A2A7B5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Prdm2A2A7B5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Prdm2A2A7B5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Prdm2A2A7B5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Prdm2A2A7B5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Prdm2A2A7B5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
Prdm2A2A7B5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Prdm2A2A7B5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Prdm2A2A7B5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Prdm2A2A7B5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Prdm2A2A7B5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Prdm2A2A7B5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Prdm2A2A7B5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Prdm2A2A7B5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
Prdm2A2A7B5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Prdm2A2A7B5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Prdm2A2A7B5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Prdm2A2A7B5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Prdm2A2A7B5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Prdm2A2A7B5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Prdm2A2A7B5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Prdm2A2A7B5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Prdm2A2A7B5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Prdm2A2A7B5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Prdm2A2A7B5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Prdm2A2A7B5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Prdm2A2A7B5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Prdm2A2A7B5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.47
Prdm2A2A7B5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
Prdm2A2A7B5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Prdm2A2A7B5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Prdm2A2A7B5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Prdm2A2A7B5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Prdm2A2A7B5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Prdm2A2A7B5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Prdm2A2A7B5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Prdm2A2A7B5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Prdm2A2A7B5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Prdm2A2A7B5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Prdm2A2A7B5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Prdm2A2A7B5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Prdm2A2A7B5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Prdm2A2A7B5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Prdm2A2A7B5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Prdm2A2A7B5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Prdm2A2A7B5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Prdm2A2A7B5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Prdm2A2A7B5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Prdm2A2A7B5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Prdm2A2A7B5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Prdm2A2A7B5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Prdm2A2A7B5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Prdm2A2A7B5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Prdm2A2A7B5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Prdm2A2A7B5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Prdm2A2A7B5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
Prdm2A2A7B5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Prdm2A2A7B5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Prdm2A2A7B5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Prdm2A2A7B5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Prdm2A2A7B5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Prdm2A2A7B5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Prdm2A2A7B5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Prdm2A2A7B5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Prdm2A2A7B5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Prdm2A2A7B5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Prdm2A2A7B5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Prdm2A2A7B5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Prdm2A2A7B5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Prdm2A2A7B5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Prdm2A2A7B5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Prdm2A2A7B5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Prdm2A2A7B5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Prdm2A2A7B5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Prdm2A2A7B5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Prdm2A2A7B5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Prdm2A2A7B5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Prdm2A2A7B5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Prdm2A2A7B5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Prdm2A2A7B5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Prdm2A2A7B5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Prdm2A2A7B5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Prdm2A2A7B5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Prdm2A2A7B5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Prdm2A2A7B5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Prdm2A2A7B5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Prdm2A2A7B5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Prdm2A2A7B5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Prdm2A2A7B5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Prdm2A2A7B5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Prdm2A2A7B5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms