Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fbxo47A2A6H3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fbxo47A2A6H3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fbxo47A2A6H3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fbxo47A2A6H3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Fbxo47A2A6H3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fbxo47A2A6H3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fbxo47A2A6H3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fbxo47A2A6H3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fbxo47A2A6H3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fbxo47A2A6H3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fbxo47A2A6H3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fbxo47A2A6H3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbxo47A2A6H3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fbxo47A2A6H3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fbxo47A2A6H3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fbxo47A2A6H3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fbxo47A2A6H3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fbxo47A2A6H3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fbxo47A2A6H3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fbxo47A2A6H3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbxo47A2A6H3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbxo47A2A6H3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fbxo47A2A6H3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fbxo47A2A6H3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fbxo47A2A6H3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fbxo47A2A6H3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fbxo47A2A6H3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fbxo47A2A6H3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fbxo47A2A6H3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fbxo47A2A6H3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fbxo47A2A6H3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fbxo47A2A6H3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fbxo47A2A6H3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fbxo47A2A6H3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fbxo47A2A6H3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fbxo47A2A6H3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Fbxo47A2A6H3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fbxo47A2A6H3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fbxo47A2A6H3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fbxo47A2A6H3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fbxo47A2A6H3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fbxo47A2A6H3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fbxo47A2A6H3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fbxo47A2A6H3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbxo47A2A6H3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbxo47A2A6H3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fbxo47A2A6H3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Fbxo47A2A6H3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fbxo47A2A6H3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Fbxo47A2A6H3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fbxo47A2A6H3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fbxo47A2A6H3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fbxo47A2A6H3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fbxo47A2A6H3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fbxo47A2A6H3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fbxo47A2A6H3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbxo47A2A6H3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbxo47A2A6H3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbxo47A2A6H3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbxo47A2A6H3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbxo47A2A6H3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fbxo47A2A6H3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fbxo47A2A6H3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fbxo47A2A6H3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fbxo47A2A6H3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fbxo47A2A6H3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fbxo47A2A6H3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fbxo47A2A6H3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxo47A2A6H3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxo47A2A6H3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fbxo47A2A6H3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fbxo47A2A6H3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fbxo47A2A6H3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fbxo47A2A6H3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Fbxo47A2A6H3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fbxo47A2A6H3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fbxo47A2A6H3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fbxo47A2A6H3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fbxo47A2A6H3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fbxo47A2A6H3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Fbxo47A2A6H3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Fbxo47A2A6H3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Fbxo47A2A6H3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fbxo47A2A6H3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fbxo47A2A6H3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fbxo47A2A6H3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Fbxo47A2A6H3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fbxo47A2A6H3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fbxo47A2A6H3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Fbxo47A2A6H3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fbxo47A2A6H3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fbxo47A2A6H3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fbxo47A2A6H3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fbxo47A2A6H3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fbxo47A2A6H3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fbxo47A2A6H3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fbxo47A2A6H3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fbxo47A2A6H3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fbxo47A2A6H3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms