Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Cul4bA2A432 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Cul4bA2A432 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Cul4bA2A432 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Cul4bA2A432 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28,51■■■□□ 2,16
Cul4bA2A432 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Cul4bA2A432 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Cul4bA2A432 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Cul4bA2A432 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Cul4bA2A432 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,15
Cul4bA2A432 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Cul4bA2A432 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28,44■■■□□ 2,14
Cul4bA2A432 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Cul4bA2A432 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Cul4bA2A432 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Cul4bA2A432 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Cul4bA2A432 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
Cul4bA2A432 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Cul4bA2A432 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Cul4bA2A432 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Cul4bA2A432 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28,39■■■□□ 2,14
Cul4bA2A432 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,39■■■□□ 2,13
Cul4bA2A432 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28,37■■■□□ 2,13
Cul4bA2A432 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Cul4bA2A432 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Cul4bA2A432 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Cul4bA2A432 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Cul4bA2A432 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Cul4bA2A432 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Cul4bA2A432 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Cul4bA2A432 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Cul4bA2A432 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Cul4bA2A432 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Cul4bA2A432 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Cul4bA2A432 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Cul4bA2A432 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Cul4bA2A432 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Cul4bA2A432 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Cul4bA2A432 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Cul4bA2A432 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Cul4bA2A432 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28,24■■■□□ 2,11
Cul4bA2A432 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Cul4bA2A432 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Cul4bA2A432 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Cul4bA2A432 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Cul4bA2A432 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Cul4bA2A432 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Cul4bA2A432 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Cul4bA2A432 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28,23■■■□□ 2,11
Cul4bA2A432 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
Cul4bA2A432 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28,2■■■□□ 2,1
Cul4bA2A432 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Cul4bA2A432 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Cul4bA2A432 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Cul4bA2A432 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Cul4bA2A432 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Cul4bA2A432 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Cul4bA2A432 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Cul4bA2A432 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28,16■■■□□ 2,1
Cul4bA2A432 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Cul4bA2A432 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Cul4bA2A432 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Cul4bA2A432 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28,11■■■□□ 2,09
Cul4bA2A432 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Cul4bA2A432 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Cul4bA2A432 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Cul4bA2A432 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Cul4bA2A432 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Cul4bA2A432 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Cul4bA2A432 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Cul4bA2A432 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Cul4bA2A432 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Cul4bA2A432 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Cul4bA2A432 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Cul4bA2A432 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Cul4bA2A432 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28,01■■■□□ 2,07
Cul4bA2A432 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Cul4bA2A432 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Cul4bA2A432 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Cul4bA2A432 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Cul4bA2A432 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Cul4bA2A432 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Cul4bA2A432 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Cul4bA2A432 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Cul4bA2A432 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Cul4bA2A432 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Cul4bA2A432 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Cul4bA2A432 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Cul4bA2A432 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Cul4bA2A432 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Cul4bA2A432 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Cul4bA2A432 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Cul4bA2A432 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Cul4bA2A432 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Cul4bA2A432 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Cul4bA2A432 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Cul4bA2A432 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Cul4bA2A432 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Cul4bA2A432 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27,91■■■□□ 2,06
Cul4bA2A432 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,4 ms