Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Gm6268A2A3U9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Gm6268A2A3U9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Gm6268A2A3U9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Gm6268A2A3U9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Gm6268A2A3U9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Gm6268A2A3U9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Gm6268A2A3U9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Gm6268A2A3U9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Gm6268A2A3U9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Gm6268A2A3U9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Gm6268A2A3U9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Gm6268A2A3U9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Gm6268A2A3U9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Gm6268A2A3U9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Gm6268A2A3U9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Gm6268A2A3U9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Gm6268A2A3U9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Gm6268A2A3U9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Gm6268A2A3U9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Gm6268A2A3U9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Gm6268A2A3U9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Gm6268A2A3U9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Gm6268A2A3U9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Gm6268A2A3U9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Gm6268A2A3U9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Gm6268A2A3U9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Gm6268A2A3U9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Gm6268A2A3U9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Gm6268A2A3U9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Gm6268A2A3U9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Gm6268A2A3U9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Gm6268A2A3U9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Gm6268A2A3U9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Gm6268A2A3U9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Gm6268A2A3U9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Gm6268A2A3U9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Gm6268A2A3U9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Gm6268A2A3U9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Gm6268A2A3U9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Gm6268A2A3U9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Gm6268A2A3U9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Gm6268A2A3U9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Gm6268A2A3U9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Gm6268A2A3U9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Gm6268A2A3U9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Gm6268A2A3U9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Gm6268A2A3U9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Gm6268A2A3U9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Gm6268A2A3U9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Gm6268A2A3U9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Gm6268A2A3U9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Gm6268A2A3U9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Gm6268A2A3U9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Gm6268A2A3U9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Gm6268A2A3U9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Gm6268A2A3U9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Gm6268A2A3U9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Gm6268A2A3U9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Gm6268A2A3U9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Gm6268A2A3U9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Gm6268A2A3U9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Gm6268A2A3U9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Gm6268A2A3U9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Gm6268A2A3U9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Gm6268A2A3U9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Gm6268A2A3U9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Gm6268A2A3U9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Gm6268A2A3U9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Gm6268A2A3U9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Gm6268A2A3U9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Gm6268A2A3U9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Gm6268A2A3U9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Gm6268A2A3U9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Gm6268A2A3U9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Gm6268A2A3U9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Gm6268A2A3U9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Gm6268A2A3U9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Gm6268A2A3U9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Gm6268A2A3U9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Gm6268A2A3U9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Gm6268A2A3U9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Gm6268A2A3U9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Gm6268A2A3U9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Gm6268A2A3U9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Gm6268A2A3U9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Gm6268A2A3U9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Gm6268A2A3U9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Gm6268A2A3U9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Gm6268A2A3U9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Gm6268A2A3U9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Gm6268A2A3U9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Gm6268A2A3U9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Gm6268A2A3U9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Gm6268A2A3U9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Gm6268A2A3U9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Gm6268A2A3U9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Gm6268A2A3U9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Gm6268A2A3U9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Gm6268A2A3U9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms