Protein–RNA interactions for Protein: A0A1Y7VIZ1

Platr25, Pluripotency-associated transcript 25, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Platr25A0A1Y7VIZ1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Platr25A0A1Y7VIZ1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Platr25A0A1Y7VIZ1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Platr25A0A1Y7VIZ1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Platr25A0A1Y7VIZ1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Platr25A0A1Y7VIZ1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Platr25A0A1Y7VIZ1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Platr25A0A1Y7VIZ1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Platr25A0A1Y7VIZ1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Platr25A0A1Y7VIZ1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Platr25A0A1Y7VIZ1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Platr25A0A1Y7VIZ1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Platr25A0A1Y7VIZ1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Platr25A0A1Y7VIZ1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Platr25A0A1Y7VIZ1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Platr25A0A1Y7VIZ1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Platr25A0A1Y7VIZ1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Platr25A0A1Y7VIZ1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Platr25A0A1Y7VIZ1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Platr25A0A1Y7VIZ1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Platr25A0A1Y7VIZ1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Platr25A0A1Y7VIZ1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Platr25A0A1Y7VIZ1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Platr25A0A1Y7VIZ1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Platr25A0A1Y7VIZ1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Platr25A0A1Y7VIZ1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Platr25A0A1Y7VIZ1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Platr25A0A1Y7VIZ1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Platr25A0A1Y7VIZ1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Platr25A0A1Y7VIZ1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Platr25A0A1Y7VIZ1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Platr25A0A1Y7VIZ1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Platr25A0A1Y7VIZ1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Platr25A0A1Y7VIZ1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Platr25A0A1Y7VIZ1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Platr25A0A1Y7VIZ1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Platr25A0A1Y7VIZ1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Platr25A0A1Y7VIZ1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Platr25A0A1Y7VIZ1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Platr25A0A1Y7VIZ1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Platr25A0A1Y7VIZ1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Platr25A0A1Y7VIZ1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Platr25A0A1Y7VIZ1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Platr25A0A1Y7VIZ1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Platr25A0A1Y7VIZ1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Platr25A0A1Y7VIZ1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Platr25A0A1Y7VIZ1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Platr25A0A1Y7VIZ1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Platr25A0A1Y7VIZ1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Platr25A0A1Y7VIZ1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Platr25A0A1Y7VIZ1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Platr25A0A1Y7VIZ1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Platr25A0A1Y7VIZ1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Platr25A0A1Y7VIZ1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Platr25A0A1Y7VIZ1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Platr25A0A1Y7VIZ1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Platr25A0A1Y7VIZ1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Platr25A0A1Y7VIZ1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Platr25A0A1Y7VIZ1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Platr25A0A1Y7VIZ1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Platr25A0A1Y7VIZ1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Platr25A0A1Y7VIZ1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Platr25A0A1Y7VIZ1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Platr25A0A1Y7VIZ1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Platr25A0A1Y7VIZ1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Platr25A0A1Y7VIZ1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Platr25A0A1Y7VIZ1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Platr25A0A1Y7VIZ1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Platr25A0A1Y7VIZ1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Platr25A0A1Y7VIZ1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Platr25A0A1Y7VIZ1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Platr25A0A1Y7VIZ1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Platr25A0A1Y7VIZ1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Platr25A0A1Y7VIZ1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Platr25A0A1Y7VIZ1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Platr25A0A1Y7VIZ1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Platr25A0A1Y7VIZ1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Platr25A0A1Y7VIZ1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Platr25A0A1Y7VIZ1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Platr25A0A1Y7VIZ1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Platr25A0A1Y7VIZ1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Platr25A0A1Y7VIZ1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Platr25A0A1Y7VIZ1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Platr25A0A1Y7VIZ1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Platr25A0A1Y7VIZ1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Platr25A0A1Y7VIZ1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Platr25A0A1Y7VIZ1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Platr25A0A1Y7VIZ1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms